49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0970 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0970  Cro/CI family transcriptional regulator  100 
 
 		 95 aa  184  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0726306  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0955  XRE family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 232 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1242  helix-turn-helix domain protein  32.58 
 
 		 254 aa  53.9  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.471276  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 204 aa  50.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1274  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.222413  normal  0.176639 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0134  transcriptional regulator, XRE family  30.3 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000191075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  47  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0039  PbsX family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.81047  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  31.37 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  33.93 
 
 		 347 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3746  putative prophage repressor  29.33 
 
 		 216 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 		 825 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0552  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.162215  hitchhiker  0.0000852105 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2624  XRE family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00551798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1478  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0909  transcriptional regulator, XRE family  29.69 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0130  putative prophage repressor  37.29 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  31.37 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  33.33 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0557  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 89 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 244 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1840  transcriptional regulator, XRE family  30.91 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  29.11 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 179 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2058  transcriptional repressor DicA  35 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.211333  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2073  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0932046  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 321 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4293  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 239 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  31.65 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1255  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 242 aa  40.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0691404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 196 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1535  transcriptional regulator, LacI family  32.69 
 
 		 465 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.38669  decreased coverage  0.00974115 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 224 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2593  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 116 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>