More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0129 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0129  transcriptional regulator/sugar kinase, xylose operon regulator  100 
 
 		 389 aa  792    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2517  xylose repressor  33.07 
 
 		 369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0778227  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0032  ROK family protein  33.07 
 
 		 369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0032  ROK family protein  33.07 
 
 		 369 aa  200  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  29.02 
 
 		 381 aa  166  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.73 
 
 		 395 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.18 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  31.73 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  25.97 
 
 		 409 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  24.79 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  26.29 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  25.7 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.37 
 
 		 399 aa  97.1  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  29.15 
 
 		 364 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  27.64 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.59 
 
 		 414 aa  93.6  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  23.57 
 
 		 404 aa  93.2  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  28.89 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.23 
 
 		 383 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  22.53 
 
 		 399 aa  90.1  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0289  ROK family protein  25.07 
 
 		 404 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  25.19 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  26.85 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  26.69 
 
 		 442 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  25.15 
 
 		 418 aa  87  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  24.81 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  26.69 
 
 		 420 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  25.46 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.47 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  23.77 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  27.87 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  25.93 
 
 		 396 aa  83.2  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  27.41 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0260  ROK family protein  23.88 
 
 		 404 aa  82.8  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3392  ROK family protein  25.7 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  24.62 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  25.07 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  24.17 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  24.02 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  28.51 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  26.12 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  27.14 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
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NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  24.65 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  24.8 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  24.62 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_0174  ROK family protein  25.3 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  23.5 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  23.13 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009620  Smed_4558  ROK family protein  28.15 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.864466 
 
 
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NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  29.6 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  25.1 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  23.37 
 
 		 396 aa  79.3  0.00000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  25.93 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  26.77 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
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NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  23.74 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  25.15 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  26.72 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  23.95 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2951  ROK family protein  23.81 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3560  ROK domain-containing protein  24.75 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  25.66 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  26.78 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  26.78 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1108  ROK family protein  26.36 
 
 		 382 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  25.1 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  26.71 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  26.67 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  25.59 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  26.05 
 
 		 387 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  24.8 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  25.59 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  26.01 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  23.83 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  25.59 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  26.67 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  26.67 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  24.85 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  25 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  26.67 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
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NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  23.62 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  24.62 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  26.42 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_1925  ROK family protein  26.53 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.300813  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  25.19 
 
 		 392 aa  74.3  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010483  TRQ2_0118  ROK family protein  24.4 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  25.21 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  25.23 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  25.45 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  23.84 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  25.45 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3047  ROK family protein  23.53 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.229024  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  25.45 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  25.45 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  25.45 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
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NC_009486  Tpet_0120  ROK family protein  24.8 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  25.45 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
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NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  25.45 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  25.45 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  25.45 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
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