More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0733 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  100 
 
 		 488 aa  1006    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  54.91 
 
 		 503 aa  546  1e-154  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  51.48 
 
 		 474 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  48.71 
 
 		 491 aa  421  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  49.08 
 
 		 477 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  42.53 
 
 		 487 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  45.71 
 
 		 451 aa  348  8e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  48.24 
 
 		 678 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  53.75 
 
 		 543 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  45.18 
 
 		 490 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  42.35 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  48.45 
 
 		 778 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  46.34 
 
 		 457 aa  302  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  42.76 
 
 		 829 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  43.17 
 
 		 756 aa  297  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  42.01 
 
 		 454 aa  296  5e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  52.23 
 
 		 495 aa  292  9e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  42.61 
 
 		 371 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  42.24 
 
 		 373 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  39.12 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  41.24 
 
 		 815 aa  282  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  41.46 
 
 		 474 aa  282  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  42.3 
 
 		 628 aa  281  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  41.01 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  43.95 
 
 		 820 aa  273  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  49.51 
 
 		 1001 aa  268  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  40 
 
 		 347 aa  266  4e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  39.37 
 
 		 347 aa  266  8e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  41.4 
 
 		 333 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  41.07 
 
 		 837 aa  259  6e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  47.6 
 
 		 497 aa  257  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  38.83 
 
 		 472 aa  256  7e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  43.62 
 
 		 383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  42.57 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  41.71 
 
 		 398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  38.36 
 
 		 451 aa  245  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  41.22 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  43.34 
 
 		 309 aa  230  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  41.41 
 
 		 370 aa  227  4e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  38.54 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  41.61 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  37.98 
 
 		 375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  38.54 
 
 		 328 aa  205  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  37.41 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  38.38 
 
 		 323 aa  196  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 407 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  39.22 
 
 		 1478 aa  193  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  38.64 
 
 		 1019 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  42.86 
 
 		 1037 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  36.39 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  32.68 
 
 		 364 aa  183  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  33.33 
 
 		 369 aa  182  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  37.83 
 
 		 1041 aa  182  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07401  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  34.57 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  39.26 
 
 		 366 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  36.28 
 
 		 689 aa  180  7e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  36.16 
 
 		 370 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  35.99 
 
 		 697 aa  177  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  36.24 
 
 		 370 aa  176  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  37.72 
 
 		 331 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  34.93 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  37.5 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  33.8 
 
 		 357 aa  171  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  38.18 
 
 		 324 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  35.5 
 
 		 357 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  37.69 
 
 		 1059 aa  167  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  37.69 
 
 		 1059 aa  167  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  37.37 
 
 		 374 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  33.9 
 
 		 1018 aa  166  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  37.73 
 
 		 338 aa  166  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  32.49 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  34.75 
 
 		 321 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  34.78 
 
 		 401 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  36.42 
 
 		 619 aa  163  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  32.5 
 
 		 486 aa  162  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0668  twin-arginine translocation pathway signal  34.69 
 
 		 368 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.710822 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  32.42 
 
 		 337 aa  161  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2962  glycoside hydrolase family 10  34.12 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0820888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  32.19 
 
 		 1495 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  31.43 
 
 		 1050 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  35.88 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  32.21 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  35.69 
 
 		 1020 aa  149  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  32.13 
 
 		 388 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1373  glycoside hydrolase family protein  30.3 
 
 		 382 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0283938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1068  Endo-1,4-beta-xylanase  32.72 
 
 		 912 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0377061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  32.04 
 
 		 382 aa  144  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.57 
 
 		 770 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  33.52 
 
 		 1780 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.8 
 
 		 1146 aa  139  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  30 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  30.52 
 
 		 392 aa  137  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2793  glycoside hydrolase family 10  29.63 
 
 		 561 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0410963 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26810  beta-1,4-xylanase  30.62 
 
 		 566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.400635 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  32.49 
 
 		 1331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  30.03 
 
 		 806 aa  130  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1838  glycoside hydrolase family protein  28.05 
 
 		 619 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.561717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  32.2 
 
 		 1215 aa  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  29.88 
 
 		 1077 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  31.72 
 
 		 756 aa  120  6e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>