213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2451 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2451  Rhomboid family protein  100 
 
 		 326 aa  655    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2632  Rhomboid family protein  58.77 
 
 		 310 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2965  Rhomboid family protein  58.73 
 
 		 318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.58204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1128  Rhomboid family protein  56.73 
 
 		 319 aa  316  4e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0599  AN1-type Zinc finger protein  46.95 
 
 		 321 aa  249  5e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.715069  normal  0.614872 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  29.19 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  34.42 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  35.19 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  35.4 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3064  Rhomboid family protein  35.15 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  33.55 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  32.24 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  27.37 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0827  rhomboid family protein  34.36 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2282  Allergen V5/Tpx-1 family protein  57.14 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  29.61 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  30.27 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  28.14 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  28.95 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1300  Rhomboid family protein  32.26 
 
 		 239 aa  65.5  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2518  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3565  rhomboid-like protein  32.72 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1404  rhomboid family protein  32.43 
 
 		 238 aa  62.4  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.334243 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  29.61 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  31.01 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  31.14 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1658  rhomboid family protein  30.46 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.598011  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2949  AN1-type Zinc finger protein  46.48 
 
 		 90 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1730  rhomboid family protein  30.38 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0105821  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  29.03 
 
 		 228 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1225  regulatory proteins, IclR  29.88 
 
 		 249 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 541 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  33.77 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1579  rhomboid family protein  30.12 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279558  hitchhiker  0.00570549 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1090  rhomboid family protein  32.89 
 
 		 184 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4172  Rhomboid family protein  29.12 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  33.77 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  31.21 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4278  Rhomboid family protein  28.31 
 
 		 234 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  32.26 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1771  rhomboid-like protein  27.43 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.604427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2304  Rhomboid family protein  36.76 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  29.05 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  30.47 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  28.65 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1151  rhomboid-like protein  34.78 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000385696  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0568  rhomboid family protein  32.31 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6097  Rhomboid family protein  30.69 
 
 		 252 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0830001 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  29.66 
 
 		 234 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4331  rhomboid family protein  33.33 
 
 		 232 aa  55.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  32.14 
 
 		 541 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0267  rhomboid family protein  31.67 
 
 		 231 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0342264 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  32.28 
 
 		 232 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0210  rhomboid family protein  27.32 
 
 		 249 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  32.14 
 
 		 547 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1787  AN1-type Zinc finger protein  41.07 
 
 		 73 aa  55.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  30.91 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  29.29 
 
 		 231 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  28.39 
 
 		 229 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  25.8 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1335  Rhomboid family protein  25.36 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.931204  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1970  rhomboid family protein  28.49 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  31.85 
 
 		 224 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_6645  predicted protein  28.7 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0872317 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1657  rhomboid family protein  32.05 
 
 		 222 aa  54.3  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000107341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2049  uncharacterized membrane protein  29.38 
 
 		 222 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3096  rhomboid family protein  30.36 
 
 		 231 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654608 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4170  Rhomboid family protein  28.21 
 
 		 214 aa  53.9  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.303634  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0860  Rhomboid family protein  28.47 
 
 		 250 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0851  rhomboid family protein  32.08 
 
 		 241 aa  53.1  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1885  rhomboid family protein  32.5 
 
 		 246 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0593974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  31.48 
 
 		 265 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1066  rhomboid-like protein  32.28 
 
 		 225 aa  52.8  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206905  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  27.17 
 
 		 525 aa  53.1  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0095  glpG protein  34.21 
 
 		 276 aa  53.1  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000920194  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3705  rhomboid family protein  27.93 
 
 		 364 aa  52.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  34.58 
 
 		 160 aa  52.8  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  31.48 
 
 		 261 aa  52.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  29.82 
 
 		 260 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2108  rhomboid-like protein  32.24 
 
 		 239 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.813228  normal  0.21449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0458  Zinc finger, AN1-type  43.18 
 
 		 111 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0941  Rhomboid family protein  29.48 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0950  rhomboid family protein  29.48 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0400  Rhomboid family protein  32.64 
 
 		 211 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  29.82 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  33.81 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0482  Rhomboid family protein  27.92 
 
 		 241 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2531  rhomboid family protein  27.22 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.751924 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0788  Rhomboid family protein  29.09 
 
 		 288 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  30 
 
 		 274 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1263  Rhomboid family protein  26.82 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1489  rhomboid-like protein  29.21 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.726859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  30.43 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3526  Rhomboid family protein  30 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1727  rhomboid family protein  35.56 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2325  rhomboid family protein  35.71 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.555664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1000  rhomboid family protein  32 
 
 		 247 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0762405 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  29.82 
 
 		 229 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  32.45 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0460  rhomboid-like protein  32.03 
 
 		 204 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0322234  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>