129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1071 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 489 aa  967    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  23.27 
 
 		 488 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3073  polysaccharide biosynthesis protein  23.88 
 
 		 491 aa  87  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1673  polysaccharide biosynthesis protein  22.89 
 
 		 487 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0823  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.110638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1525  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 		 475 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  25.96 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  28.67 
 
 		 526 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 490 aa  77  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 489 aa  73.6  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0577  polysaccharide biosynthesis protein  30.63 
 
 		 500 aa  68.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1538  polysaccharide biosynthesis protein  26.17 
 
 		 480 aa  67.8  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1684  polysaccharide biosynthesis protein  23.48 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.821727  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  28.72 
 
 		 504 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2459  polysaccharide biosynthesis protein  22.9 
 
 		 490 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  23.86 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  25.98 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0772  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 488 aa  63.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330011  normal  0.358074 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  28.91 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03555  polysaccharide biosynthesis protein  25.69 
 
 		 461 aa  63.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  28.18 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  27.8 
 
 		 529 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 		 423 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  24.81 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  20.57 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0093  polysaccharide biosynthesis protein  26.71 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  28.92 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  22.6 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  24.9 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1062  multi anti extrusion protein MatE  26.18 
 
 		 464 aa  57  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2435  polysaccharide biosynthesis protein  19.73 
 
 		 481 aa  57  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  24.87 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 		 486 aa  55.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0705  polysaccharide biosynthesis protein  20.08 
 
 		 505 aa  55.1  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0668809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  26 
 
 		 482 aa  55.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 446 aa  53.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2403  O-antigen and teichoic acid export protein  24.77 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000847308  normal  0.232993 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0344  polysaccharide biosynthesis protein  28.41 
 
 		 430 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0233913 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  22.09 
 
 		 442 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  20.65 
 
 		 504 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  30.07 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1922  polysaccharide biosynthesis family protein  23.64 
 
 		 544 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  20.71 
 
 		 477 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0050  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 529 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1476  polysaccharide biosynthesis protein  26.87 
 
 		 478 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.41524 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1681  polysaccharide biosynthesis family protein  23.45 
 
 		 544 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.960771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1656  polysaccharide biosynthesis protein; spore cortex protein  23.64 
 
 		 544 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.177668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4442  polysaccharide biosynthesis protein  24.9 
 
 		 398 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1700  polysaccharide biosynthesis family protein  23.66 
 
 		 544 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.312469  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0172  polysaccharide efflux transporter, putative  26.74 
 
 		 495 aa  51.2  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.377433 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1834  polysaccharide biosynthesis family protein  23.66 
 
 		 544 aa  51.2  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3713  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 		 445 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.336357  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  29.87 
 
 		 455 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  24.01 
 
 		 475 aa  50.4  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1957  polysaccharide synthase family protein  23.38 
 
 		 544 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1878  polysaccharide synthase family protein  23.45 
 
 		 544 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0013771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 440 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  25.1 
 
 		 476 aa  50.1  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.42 
 
 		 423 aa  50.1  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0537  polysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 		 485 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1425  polysaccharide transporter  23.21 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.524088  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  21.43 
 
 		 471 aa  49.7  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1370  integral membrane protein MviN  25.14 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000411577  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0024  polysaccharide biosynthesis protein  23.22 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.014677  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3259  polysaccharide biosynthesis protein  22.47 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0605  polysaccharide biosynthesis protein  26.53 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000992142  hitchhiker  0.0000000137366 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1407  PST family polysaccharide transporter  22.46 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  22.17 
 
 		 477 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  23.77 
 
 		 512 aa  49.3  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2760  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 542 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.874111  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  28.18 
 
 		 482 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0582  polysaccharide biosynthesis protein  21.28 
 
 		 479 aa  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3014  putative exopolysaccharide biosynthesis protein  24.66 
 
 		 422 aa  48.5  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0464  polysaccharide transporter protein, putative  26.25 
 
 		 486 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000125112  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  27.97 
 
 		 486 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  23.32 
 
 		 495 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0220  PST family polysaccharide transporter  20.8 
 
 		 472 aa  47.4  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  23.81 
 
 		 427 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  26.2 
 
 		 490 aa  46.6  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 475 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0722  hypothetical protein  21.62 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  23.17 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1623  polysaccharide biosynthesis protein  23.92 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  24.57 
 
 		 539 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0629  lipopolysaccharide/O-antigen transporter, putative  25.43 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0604  polysaccharide biosynthesis protein  22.01 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000572815  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0468  integral membrane protein MviN  24.81 
 
 		 513 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0243  polysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  19.81 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  21.57 
 
 		 499 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>