More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1706 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1706  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 317 aa  635    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0459  transcriptional regulator, LysR family  50.84 
 
 		 308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00764777  normal  0.120091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2499  LysR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 278 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2321  putative transcriptional regulator  44.63 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2247  LysR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4455  LysR family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 301 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6857  LysR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 307 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561705  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1270  LysR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 301 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4578  LysR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27440  putative transcriptional regulator  44.37 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016223  normal  0.601013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46370  Transcriptional regulator, LysR-family  45.23 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992428  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0871  LysR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 302 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0141  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3381  transcriptional regulator, LysR family  41.55 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.750017  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1811  transcriptional regulator, LysR family  42.27 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193528  hitchhiker  0.00243987 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1317  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.631225  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  41.92 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3382  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1528  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6632  LysR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3501  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.356591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1659  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 314 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.337839  normal  0.66809 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0017  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5422  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 295 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906945  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0978  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024266 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5440  LysR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4829  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732539 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2417  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000194873  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3422  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3329  LysR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 323 aa  187  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4870  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5091  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.269776 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1717  transcriptional regulator, LysR family  39.36 
 
 		 323 aa  182  9.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4909  transcriptional regulator, LysR family  39.72 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0543  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6199  transcriptional regulator, LysR family  41.05 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2151  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1887  transcriptional regulator, LysR family  37.62 
 
 		 321 aa  169  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.337699  normal  0.210949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0399  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3409  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155989  normal  0.11434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3916  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.61928 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2085  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0073681  normal  0.210389 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3528  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3520  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.677616 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4363  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 339 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4003  LysR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 339 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2136  transcriptional regulator, LysR family  37.24 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2067  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1724  transcriptional regulator  30.74 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2839  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 300 aa  139  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  32.24 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2045  transcriptional regulator, LysR family  34.89 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1755  LysR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 301 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4218  transcriptional regulator, LysR family  32.85 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  27.3 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0997  transcriptional regulator, LysR family  32.23 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.940452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1878  LysR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 305 aa  122  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0794  transcriptional regulator, LysR family protein  27.89 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1773  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3932  transcriptional regulator  29.45 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00420556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1145  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610214  normal  0.415034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.07 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0158  LysR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 342 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000138303  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0216  transcriptional regulator, LysR family  29.58 
 
 		 313 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000946054  normal  0.293728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3805  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.829403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3262  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 304 aa  119  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 318 aa  119  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0257  LysR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 331 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  29 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3734  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457361 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2446  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 327 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4244  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000170817  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3445  LysR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000626744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3500  LysR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0910886  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4123  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000527418  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 323 aa  116  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0214  LysR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000152565  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3947  LysR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 321 aa  116  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01325  transcriptional regulator, LysR family protein  30.74 
 
 		 314 aa  115  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0352  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 299 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  32.54 
 
 		 298 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01749  Transcriptional Regulator, LysR family protein  27.09 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122215  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0324  LysR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1092  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  28.38 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0693  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 300 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3111  LysR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  28.29 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5282  LysR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 310 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0737  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210121 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  26.16 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0112  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 319 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2234  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1974  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 317 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1767  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.406374  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0253  LysR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>