More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2136 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2136  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 303 aa  578  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4909  transcriptional regulator, LysR family  46.1 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3501  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.356591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0017  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6632  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2067  transcriptional regulator, LysR family  48.77 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4870  LysR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2417  LysR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000194873  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3382  LysR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1659  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 314 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.337839  normal  0.66809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1528  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3422  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 304 aa  182  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1717  transcriptional regulator, LysR family  39.72 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1811  transcriptional regulator, LysR family  39.32 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193528  hitchhiker  0.00243987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4218  transcriptional regulator, LysR family  45.02 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1317  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 304 aa  178  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.631225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2321  putative transcriptional regulator  36.75 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0978  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 298 aa  175  8e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024266 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6199  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 308 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4455  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2247  LysR family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1270  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6857  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561705  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4578  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1706  transcriptional regulator, LysR family  37.24 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27440  putative transcriptional regulator  37.75 
 
 		 321 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016223  normal  0.601013 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4003  LysR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4363  LysR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46370  Transcriptional regulator, LysR-family  40.07 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992428  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3520  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 319 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.677616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2085  LysR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0073681  normal  0.210389 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3528  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 353 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0399  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3409  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155989  normal  0.11434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1887  transcriptional regulator, LysR family  36.9 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.337699  normal  0.210949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3916  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.61928 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5440  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0141  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0459  transcriptional regulator, LysR family  34.92 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00764777  normal  0.120091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4829  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5422  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5091  transcriptional regulator, LysR family  42.11 
 
 		 328 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.269776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0871  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0543  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 309 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3329  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2499  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 278 aa  149  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0158  LysR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 342 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000138303  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2839  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4143  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 318 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00216178  hitchhiker  0.000662316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3381  transcriptional regulator, LysR family  31.23 
 
 		 305 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.750017  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4123  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000527418  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0145  transcriptional regulator, LysR family  34.08 
 
 		 326 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3734  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0216  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000946054  normal  0.293728 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4244  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000170817  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0214  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000152565  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2073  transcriptional regulator, LysR family protein  32.55 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3500  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 313 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0910886  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3449  regulatory protein, LysR  31.09 
 
 		 326 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3805  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 311 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.829403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2331  LysR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3932  transcriptional regulator  31.77 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00420556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0324  LysR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 313 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00455  transcriptional regulator  31.31 
 
 		 341 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  35.57 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3889  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  34.43 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2971  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  31.21 
 
 		 313 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0925  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 323 aa  134  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  34.64 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0253  LysR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0794  transcriptional regulator, LysR family protein  26.51 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0296  transcriptional regulator, LysR family protein  27.36 
 
 		 327 aa  132  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35272  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001991  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 314 aa  132  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3957  LysR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4139  LysR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  34.22 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3412  regulatory protein, LysR  32.65 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.366877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0519  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2640  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 315 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0100  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 318 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.183121  normal  0.148828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2018  transcription regulator protein  34.71 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.416664  normal  0.213867 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2446  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3495  regulatory protein, LysR  27.24 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.268712  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0253  LysR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.88055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3589  LysR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  30.79 
 
 		 305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1799  putative transcriptional regulator  35.57 
 
 		 304 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2635  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 297 aa  126  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>