More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_46370 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_46370  Transcriptional regulator, LysR-family  100 
 
 		 307 aa  610  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2321  putative transcriptional regulator  67.65 
 
 		 319 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27440  putative transcriptional regulator  68.95 
 
 		 321 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016223  normal  0.601013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0141  LysR family transcriptional regulator  59.02 
 
 		 305 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6857  LysR family transcriptional regulator  57.24 
 
 		 307 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561705  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3381  transcriptional regulator, LysR family  57.45 
 
 		 305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.750017  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2247  LysR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 307 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4578  LysR family transcriptional regulator  60.27 
 
 		 301 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4455  LysR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 301 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1270  LysR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 301 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0871  LysR family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 302 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0017  LysR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0459  transcriptional regulator, LysR family  46.94 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00764777  normal  0.120091 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2499  LysR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1706  transcriptional regulator, LysR family  46.44 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3382  LysR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 295 aa  242  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1811  transcriptional regulator, LysR family  46.13 
 
 		 297 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193528  hitchhiker  0.00243987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  45.79 
 
 		 298 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1317  transcriptional regulator, LysR family  44.15 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.631225  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1659  LysR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 314 aa  232  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.337839  normal  0.66809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3501  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 301 aa  232  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.356591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4870  LysR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1528  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1717  transcriptional regulator, LysR family  45.61 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0978  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 298 aa  225  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0543  LysR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6199  transcriptional regulator, LysR family  45.39 
 
 		 308 aa  218  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2151  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2417  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 306 aa  218  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000194873  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6632  LysR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3422  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 304 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4829  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 301 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5422  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906945  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5440  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3329  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3528  LysR family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 353 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4909  transcriptional regulator, LysR family  44.12 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2085  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0073681  normal  0.210389 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1887  transcriptional regulator, LysR family  39.26 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.337699  normal  0.210949 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0399  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4363  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 339 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3520  LysR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.677616 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4003  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 339 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3409  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 325 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155989  normal  0.11434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3916  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 323 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.61928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5091  transcriptional regulator, LysR family  39.45 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.269776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2067  transcriptional regulator, LysR family  41.96 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2839  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2136  transcriptional regulator, LysR family  40.83 
 
 		 303 aa  155  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0791  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  35.81 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6130  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.733212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6418  LysR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.461632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4218  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0044  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1198  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601339  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1550  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0052  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0054  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 307 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1481  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 308 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0065  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.363781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  32.67 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4455  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0044  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6630  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 320 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.466638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6397  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 320 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6228  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 345 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.196745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2535  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 307 aa  136  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.799798 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2999  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 333 aa  135  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.4449  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 314 aa  135  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  33.44 
 
 		 314 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3526  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0893193 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5356  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  32.09 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3588  LysR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2018  transcription regulator protein  35.99 
 
 		 321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.416664  normal  0.213867 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.4 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2802  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 305 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  34.13 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1878  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 305 aa  132  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3900  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4664  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0610677 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4532  transcriptional regulator, LysR family  32.78 
 
 		 305 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.695585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2495  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.025453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4499  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3620  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 305 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00938056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6276  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 317 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0594796  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2106  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.544571  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01757  transcription regulator transcription regulator protein  31.91 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.354836 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1311  LysR family transcriptional regulator  31 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.20499  normal  0.840284 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5744  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0328  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0642  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915851  normal  0.108834 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4041  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>