More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4870 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4870  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  604  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6632  LysR family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6857  LysR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561705  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3501  LysR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.356591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3382  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0017  LysR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 301 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2247  LysR family transcriptional regulator  45.82 
 
 		 307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5091  transcriptional regulator, LysR family  49.82 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.269776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3381  transcriptional regulator, LysR family  44.6 
 
 		 305 aa  218  8.999999999999998e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.750017  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2417  LysR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000194873  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  46.21 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1528  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 298 aa  215  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1811  transcriptional regulator, LysR family  46.21 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193528  hitchhiker  0.00243987 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2321  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1659  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 314 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.337839  normal  0.66809 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46370  Transcriptional regulator, LysR-family  46.95 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992428  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0141  LysR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 305 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1717  transcriptional regulator, LysR family  44.8 
 
 		 323 aa  212  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5440  LysR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 301 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4829  LysR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 301 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4455  LysR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5422  LysR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 295 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906945  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1317  transcriptional regulator, LysR family  44.33 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.631225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3329  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 323 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6199  transcriptional regulator, LysR family  45.2 
 
 		 308 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0871  LysR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0978  LysR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 298 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27440  putative transcriptional regulator  43.26 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016223  normal  0.601013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4578  LysR family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1270  LysR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 301 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3422  LysR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 304 aa  198  9e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0543  LysR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2085  LysR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0073681  normal  0.210389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4909  transcriptional regulator, LysR family  43.73 
 
 		 313 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0459  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 		 308 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00764777  normal  0.120091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1706  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1887  transcriptional regulator, LysR family  41.69 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.337699  normal  0.210949 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3528  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 353 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3916  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.61928 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3409  LysR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155989  normal  0.11434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4003  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4363  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0399  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3520  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.677616 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2136  transcriptional regulator, LysR family  43.94 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2499  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 278 aa  172  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2067  transcriptional regulator, LysR family  43.26 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2839  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4218  transcriptional regulator, LysR family  40.57 
 
 		 300 aa  152  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03220  Transcriptional regulator  31.82 
 
 		 347 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.67 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3209  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 312 aa  145  9e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.487782 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  31.56 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  37.37 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 329 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0674  LysR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 334 aa  139  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1036  transcriptional regulator of LysR family protein  32.44 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3796  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.15 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027848 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2248  transcriptional regulator, LysR family  35.93 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0456314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2165  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0776573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3088  LysR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.991899 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68550  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 302 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.505107 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01749  Transcriptional Regulator, LysR family protein  31.65 
 
 		 300 aa  135  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.122215  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3111  LysR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2020  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1414  LysR family regulatory protein  31.32 
 
 		 311 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3200  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.652853  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3073  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4143  LysR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00216178  hitchhiker  0.000662316 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1042  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 355 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1329  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 355 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2309  LysR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 355 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4334  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.106421  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5030  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.381817  normal  0.43412 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5270  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 315 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.444493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4244  LysR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000170817  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4123  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000527418  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01325  transcriptional regulator, LysR family protein  31.02 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  29.9 
 
 		 314 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0216  transcriptional regulator, LysR family  30.87 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000946054  normal  0.293728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1230  LysR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3034  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0386168  normal  0.816732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5932  putative transcriptional regulator  32.42 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1878  LysR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 305 aa  129  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4032  LysR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522955  normal  0.224362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4567  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 332 aa  129  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.227329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 314 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3500  LysR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0910886  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5845  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5015  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305612  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 314 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0214  LysR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 313 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000152565  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1231  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2155  transcriptional regulator, LysR family  35.33 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5082  LysR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>