More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2996 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 219 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  57.75 
 
 		 224 aa  201  8e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  61.05 
 
 		 272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  56.98 
 
 		 234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  58.43 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  49.75 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  66.15 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  66.15 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  52.82 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  46.24 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  48.21 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  53.04 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  49.67 
 
 		 193 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  46.82 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  51.32 
 
 		 238 aa  131  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  49.2 
 
 		 254 aa  131  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  49.39 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  43.89 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  48.79 
 
 		 232 aa  128  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  41.1 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  43.33 
 
 		 220 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  41.82 
 
 		 182 aa  121  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  54.97 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  41.82 
 
 		 204 aa  112  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  44.29 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  48.3 
 
 		 291 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  49.69 
 
 		 182 aa  106  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  44.57 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  42.31 
 
 		 190 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  42.02 
 
 		 210 aa  102  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  37.78 
 
 		 182 aa  97.8  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  40.99 
 
 		 188 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  39.71 
 
 		 149 aa  93.6  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  43.4 
 
 		 169 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 		 169 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  41.56 
 
 		 156 aa  85.9  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 		 178 aa  85.9  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2287  lipoprotein signal peptidase  38.1 
 
 		 168 aa  85.5  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 		 169 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  35.33 
 
 		 163 aa  85.1  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  36.71 
 
 		 182 aa  84.7  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  41.83 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2288  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1143  lipoprotein signal peptidase  39.42 
 
 		 165 aa  82  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  37.31 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  37.82 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  37.42 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  40.25 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  34.87 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  37.14 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 		 155 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  38.41 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  38.93 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  41.91 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1604  lipoprotein signal peptidase  48.8 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.81642  normal  0.485547 
 
 
-
 
NC_002936  DET1374  lipoprotein signal peptidase  37.23 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000912047  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  34.32 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  37.86 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0863  lipoprotein signal peptidase  37.5 
 
 		 173 aa  75.5  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  30.38 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  32.04 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 		 163 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  31.82 
 
 		 168 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  36.67 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  40.56 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 		 173 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 166 aa  72  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  40.54 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  36.08 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  41.01 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  35.23 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 		 160 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  35.14 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  40.71 
 
 		 171 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  41.01 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  32.57 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  35.26 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  36.08 
 
 		 153 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  32.03 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  32.08 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>