More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2491 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  100 
 
 		 420 aa  831    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  80.19 
 
 		 414 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  69.66 
 
 		 417 aa  541  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 429 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 400 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 432 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 427 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 415 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  31.91 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 405 aa  113  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 388 aa  97.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 391 aa  96.7  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 		 400 aa  94.4  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  29.84 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  28.89 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  28.22 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  25.46 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.37 
 
 		 460 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  24.25 
 
 		 433 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  22.27 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  21.97 
 
 		 426 aa  65.1  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  24.33 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0232  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  23.22 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 413 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  25.28 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4166  putative permease  25.07 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 432 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1442  major facilitator family transporter  36.5 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4878  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2045  major facilitator family transporter  36.5 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3102  major facilitator family transporter  36.5 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1353  major facilitator family transporter  36.5 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2335  major facilitator family transporter  36.5 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1068  major facilitator family transporter  36.5 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 417 aa  61.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3143  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4224  putative permease  24.78 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 		 449 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4209  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4044  putative permease  24.78 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4099  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.594069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5519  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.524338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 433 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5470  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4700  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.164238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>