120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0094 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2699  amidohydrolase 2  76.44 
 
 
420 aa  692    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2743  amidohydrolase 2  76.44 
 
 
420 aa  692    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4275  amidohydrolase 2  76.92 
 
 
421 aa  689    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.334283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2729  amidohydrolase 2  76.44 
 
 
420 aa  692    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.226769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2371  amidohydrolase 2  76.68 
 
 
420 aa  686    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0094  amidohydrolase 2  100 
 
 
420 aa  872    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.986217  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0583  amidohydrolase 2  92.31 
 
 
418 aa  813    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972073  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0715  amidohydrolase 2  58.25 
 
 
421 aa  532  1e-150  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548307  normal  0.202606 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4731  amidohydrolase 2  58.01 
 
 
433 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2912  amidohydrolase 2  56.8 
 
 
421 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4211  amidohydrolase 2  49.14 
 
 
447 aa  422  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432524  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2022  amidohydrolase 2  49.14 
 
 
435 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7100  amidohydrolase 2  48.89 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3745  amidohydrolase 2  49.14 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.918352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3818  amidohydrolase 2  49.14 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.583489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3757  amidohydrolase 2  49.14 
 
 
432 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.678695  normal  0.569441 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2441  amidohydrolase 2  47.9 
 
 
431 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4324  amidohydrolase 2  48.15 
 
 
434 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309533  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2534  amidohydrolase 2  47.09 
 
 
426 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2579  amidohydrolase 2  47.09 
 
 
426 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3313  amidohydrolase 2  46.45 
 
 
428 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1976  amidohydrolase 2  44.94 
 
 
437 aa  360  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0606  hypothetical protein  42.25 
 
 
437 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00678289  normal  0.125418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1884  amidohydrolase 2  43.92 
 
 
444 aa  345  7e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0904  amidohydrolase 2  40.44 
 
 
437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0215279  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  40.46 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4135  amidohydrolase 2  38.56 
 
 
400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4102  amidohydrolase 2  38.5 
 
 
388 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9303  amidohydrolase 2  38.07 
 
 
398 aa  258  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383297  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4590  amidohydrolase 2  39.02 
 
 
390 aa  257  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.236617  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3524  amidohydrolase 2  37.53 
 
 
398 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.840417 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6846  amidohydrolase 2  34.61 
 
 
401 aa  252  7e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0638  amidohydrolase 2  37.7 
 
 
402 aa  245  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.477012  normal  0.622567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  28.87 
 
 
395 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0901  amidohydrolase 2  30 
 
 
403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1749  amidohydrolase 2  28.79 
 
 
397 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.393606  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  28.13 
 
 
393 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1795  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
367 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.733672 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4702  amidohydrolase 2  26.56 
 
 
374 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00593918  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  27.51 
 
 
410 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3915  amidohydrolase 2  29.53 
 
 
391 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130175  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0386  amidohydrolase 2  26.86 
 
 
368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.988798  normal  0.321974 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3331  amidohydrolase 2  27.76 
 
 
391 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1767  amidohydrolase 2  26.94 
 
 
378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1564  amidohydrolase 2  27.09 
 
 
391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1969  amidohydrolase 2  27.23 
 
 
429 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5384  amidohydrolase 2  41.67 
 
 
306 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.31399  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0888  amidohydrolase 2  26.19 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.585046  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3645  amidohydrolase 2  24.48 
 
 
387 aa  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235315  normal  0.482267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4056  amidohydrolase 2  23.96 
 
 
378 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0140392  normal  0.467285 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  25.6 
 
 
362 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4629  amidohydrolase 2  25.53 
 
 
399 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  24.19 
 
 
389 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6370  amidohydrolase  33.7 
 
 
206 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2419  amidohydrolase 2  23.64 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.466523  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4233  amidohydrolase 2  23.76 
 
 
405 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.763151  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3766  amidohydrolase 2  22.77 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.179615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3839  amidohydrolase 2  22.77 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.964621  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3778  amidohydrolase 2  22.77 
 
 
390 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2289  amidohydrolase 2  25.7 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2288  amidohydrolase 2  26.16 
 
 
441 aa  83.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  29.11 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2250  amidohydrolase 2  26.05 
 
 
372 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.744112  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4034  amidohydrolase 2  23.33 
 
 
396 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.182386 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  27.8 
 
 
357 aa  65.1  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1755  amidohydrolase 2  21.63 
 
 
401 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4350  amidohydrolase 2  23.1 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6907  amidohydrolase 2  21.8 
 
 
398 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.717934  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2069  amidohydrolase 2  24.16 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.378937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2692  amidohydrolase 2  24.32 
 
 
392 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  27.2 
 
 
365 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2359  amidohydrolase 2  24.31 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6836  amidohydrolase 2  23.73 
 
 
399 aa  63.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0916141  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1774  amidohydrolase 2  21.88 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1821  amidohydrolase 2  21.88 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947124  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0313  amidohydrolase 2  22.88 
 
 
410 aa  60.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0959778  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4134  amidohydrolase 2  22.16 
 
 
396 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2524  amidohydrolase 2  22.16 
 
 
396 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1994  amidohydrolase 2  21.69 
 
 
415 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.580851  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3688  amidohydrolase 2  25.47 
 
 
394 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2679  amidohydrolase 2  25 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4123  amidohydrolase 2  19.62 
 
 
409 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.807085  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3792  amidohydrolase 2  20.45 
 
 
409 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.419008  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  25.68 
 
 
353 aa  57.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4312  amidohydrolase 2  22.58 
 
 
392 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  25 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2602  amidohydrolase 2  20.65 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3669  amidohydrolase 2  21.61 
 
 
396 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0599848  normal  0.323634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  24.38 
 
 
337 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2708  amidohydrolase 2  22.9 
 
 
392 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4742  amidohydrolase 2  23.51 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.65443  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6919  amidohydrolase 2  23.2 
 
 
396 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2338  amidohydrolase 2  20.45 
 
 
409 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593423  hitchhiker  0.00311861 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0533  amidohydrolase 2  22.36 
 
 
378 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210252  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4261  hypothetical protein  25.48 
 
 
366 aa  53.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2299  amidohydrolase 2  20.13 
 
 
409 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3656  amidohydrolase 2  21.43 
 
 
396 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2346  amidohydrolase 2  20.13 
 
 
409 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0981213  normal  0.498928 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3729  amidohydrolase 2  21.43 
 
 
396 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0351  amidohydrolase 2  20.07 
 
 
413 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.166644  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>