70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1147 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1147  response regulator receiver protein  100 
 
 		 397 aa  795    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2982  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.41 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4331  transcriptional regulator, AraC family  24.09 
 
 		 371 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248399  normal  0.118283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.44 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3101  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  22.54 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866891  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1038  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.07 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  0.923131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0841  AraC family transcriptional regulator  21.71 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.271665 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2599  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1306  transcriptional regulator, AraC family  24.55 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4113  transcriptional regulator, AraC family  23.41 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.197438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0537  helix-turn-helix domain-containing protein  34.43 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.379134  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3165  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.14 
 
 		 389 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3167  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1703  putative transcriptional regulator  32.33 
 
 		 294 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0448635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3025  AraC family transcriptional regulator  20.77 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000202158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0638  transcriptional regulator, AraC family  27.13 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0538  helix-turn-helix domain-containing protein  32.46 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.214837  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4302  AraC family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 269 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19800  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2203  transcriptional regulator, AraC family  30.19 
 
 		 285 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0328064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0906  helix-turn-helix domain-containing protein  26.72 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.472278 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2274  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0920  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 274 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100818  normal  0.609356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2674  AraC family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 271 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0633  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 362 aa  61.2  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.311928  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2491  response regulator receiver protein  26.9 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00299433  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6150  transcriptional regulator, AraC family  25.95 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2152  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.369795 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0876  AraC family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00939857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2928  AraC family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2999  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  23.1 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288968 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1285  helix-turn-helix domain-containing protein  26.92 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112275  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2366  AraC family transcriptional regulator  21.57 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2515  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3808  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1391  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2495  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.939158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1550  AraC family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000434853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1555  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.294968  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3153  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 364 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2491  AraC family transcriptional regulator  19.31 
 
 		 385 aa  54.3  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3809  transcriptional regulator, AraC family  19.71 
 
 		 376 aa  53.9  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3057  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0161665  normal  0.0111828 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2612  AraC family transcriptional regulator  16.82 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0404  AraC family transcriptional regulator  21.33 
 
 		 399 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3410  transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 		 359 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.493578  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3858  AraC family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 393 aa  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3204  AraC family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 317 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3234  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 106 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  26.21 
 
 		 513 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0018  AraC family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0879  transcriptional regulator, AraC family  24.81 
 
 		 363 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4147  transcriptional regulator, AraC family  24.31 
 
 		 438 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1276  transcriptional regulator AraC family  17.48 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0312  AraC/XylS family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 347 aa  46.6  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  23.33 
 
 		 319 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0732  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 331 aa  46.6  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  28.24 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 273 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1109  hypothetical protein  24.29 
 
 		 352 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  27.45 
 
 		 745 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  27.45 
 
 		 745 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0802  AraC family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 381 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1634  AraC family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 380 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.33217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  21.85 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 515 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  25.53 
 
 		 327 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  28.7 
 
 		 259 aa  43.5  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 334 aa  43.1  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2464  helix-turn-helix, AraC type  34.57 
 
 		 329 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.903798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>