108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0093 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  100 
 
 		 490 aa  1000    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  46.14 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  44.19 
 
 		 492 aa  353  2.9999999999999997e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  34.41 
 
 		 494 aa  224  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  33.92 
 
 		 463 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  32.34 
 
 		 494 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  31.86 
 
 		 481 aa  197  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  31.08 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  29.53 
 
 		 406 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  28.73 
 
 		 450 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  28.9 
 
 		 507 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  27.44 
 
 		 566 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  27.29 
 
 		 530 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  28.11 
 
 		 533 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  29.57 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  27.6 
 
 		 530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  29.5 
 
 		 538 aa  120  6e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  28.61 
 
 		 530 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  29.51 
 
 		 440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  31.32 
 
 		 527 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  30.79 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  28.88 
 
 		 496 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  29.29 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  29.3 
 
 		 518 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  27.54 
 
 		 488 aa  101  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  29.33 
 
 		 555 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  24.14 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  26.03 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  24.19 
 
 		 434 aa  53.5  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  25.11 
 
 		 554 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2514  carboxyl-terminal protease  22.61 
 
 		 506 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2740  hypothetical protein  26.5 
 
 		 447 aa  52  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.11391  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  25.4 
 
 		 427 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1953  carboxyl-terminal protease  25.65 
 
 		 711 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.568791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  23.63 
 
 		 440 aa  51.2  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  27.6 
 
 		 401 aa  51.2  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0838  Periplasmic protease-like protein  30 
 
 		 452 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1099  peptidase S41  26.14 
 
 		 428 aa  50.8  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.257556  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  27.5 
 
 		 494 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  25.35 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1357  carboxy-terminal protease  25.28 
 
 		 680 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000834708  normal  0.174046 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01801  carboxy-terminal protease for penicillin-binding protein 3  25.28 
 
 		 682 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1812  carboxyl-terminal protease  25.28 
 
 		 682 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  21.59 
 
 		 387 aa  48.5  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  24.26 
 
 		 412 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  23.11 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1921  carboxy-terminal protease  25.28 
 
 		 682 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149225  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2059  carboxy-terminal protease  25.28 
 
 		 682 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028938  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1802  carboxy-terminal protease  25.28 
 
 		 682 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0594829 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2098  carboxy-terminal protease  25.28 
 
 		 682 aa  48.5  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592203  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2563  carboxy-terminal protease  25.28 
 
 		 680 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000036056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  25.9 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01789  hypothetical protein  25.28 
 
 		 682 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  24.6 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  26.91 
 
 		 475 aa  47.4  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  25.49 
 
 		 560 aa  47.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1802  carboxy-terminal protease  26.06 
 
 		 681 aa  47.4  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.308146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  22.17 
 
 		 426 aa  47.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  21.48 
 
 		 572 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  23.79 
 
 		 440 aa  47  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2119  carboxy-terminal protease  25.28 
 
 		 678 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000159277  hitchhiker  0.000525254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2133  carboxy-terminal protease  26.32 
 
 		 690 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000755516  normal  0.0766103 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2074  carboxy-terminal protease  24.68 
 
 		 673 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0703  carboxyl-terminal protease  26.71 
 
 		 463 aa  46.6  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0168  C-terminal processing peptidase  22.76 
 
 		 564 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2400  carboxy-terminal protease  25.84 
 
 		 682 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1672  carboxy-terminal protease  24.72 
 
 		 690 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000704013  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1783  carboxy-terminal protease  24.72 
 
 		 692 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00680502  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04290  tail-specific protease  22.04 
 
 		 719 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  28.86 
 
 		 410 aa  45.8  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  23.33 
 
 		 544 aa  45.4  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3441  carboxyl-terminal protease  22.83 
 
 		 725 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0836072  normal  0.132534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1984  carboxy-terminal protease  27.27 
 
 		 682 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00711922  hitchhiker  0.00523275 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1988  carboxy-terminal protease  26.79 
 
 		 698 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.547675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1286  carboxy-terminal protease  27.27 
 
 		 682 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000018564  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1470  carboxy-terminal protease  27.27 
 
 		 682 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0690257  normal  0.257685 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  24.78 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2483  carboxy-terminal protease  25.66 
 
 		 690 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000106803  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2046  carboxy-terminal protease  27.27 
 
 		 682 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1845  carboxy-terminal protease  23.6 
 
 		 673 aa  45.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1993  carboxy-terminal protease  25.52 
 
 		 679 aa  44.7  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000930411  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  27.46 
 
 		 434 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  24.59 
 
 		 426 aa  44.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  24.6 
 
 		 429 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  23.98 
 
 		 413 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  25.45 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  21.26 
 
 		 434 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  23.98 
 
 		 413 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  25.87 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  24.83 
 
 		 556 aa  44.3  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1853  carboxy-terminal protease  26.14 
 
 		 671 aa  44.3  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.535922  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  24.5 
 
 		 550 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2141  carboxy-terminal protease  26.14 
 
 		 671 aa  44.3  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0954  peptidase S41  25.39 
 
 		 451 aa  43.9  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000432114  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  25.09 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1935  carboxy-terminal protease  25 
 
 		 681 aa  44.3  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.487036  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1217  carboxyl-terminal protease  25.77 
 
 		 674 aa  43.9  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1544  carboxy-terminal protease  24.43 
 
 		 672 aa  43.9  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>