89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_4892 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  73.95 
 
 		 1039 aa  1435    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  89.15 
 
 		 949 aa  1665    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  93.67 
 
 		 948 aa  1766    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  100 
 
 		 948 aa  1880    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  97.89 
 
 		 948 aa  1842    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2139  antigen 43, truncation  96.34 
 
 		 583 aa  1055    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  29.06 
 
 		 947 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  33.49 
 
 		 1565 aa  141  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  33.1 
 
 		 1571 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 		 1526 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.33 
 
 		 1526 aa  127  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  30.33 
 
 		 863 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  36.4 
 
 		 863 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  35.63 
 
 		 863 aa  112  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  35.63 
 
 		 836 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  35.63 
 
 		 836 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.63 
 
 		 836 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  28.67 
 
 		 1099 aa  110  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  30.71 
 
 		 1040 aa  107  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  30.08 
 
 		 1748 aa  104  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  28.87 
 
 		 1770 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  29.76 
 
 		 1770 aa  102  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  28.76 
 
 		 1115 aa  99.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  28.25 
 
 		 1753 aa  98.2  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  29.79 
 
 		 1093 aa  95.5  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  29.79 
 
 		 1093 aa  95.5  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  26.64 
 
 		 1067 aa  92.4  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1976  conserved hypothetical protein  39.47 
 
 		 418 aa  91.3  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000418237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1744  hypothetical protein  39.47 
 
 		 418 aa  91.7  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153793  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1965  hypothetical protein  39.47 
 
 		 418 aa  91.7  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.646442  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2377  hypothetical protein  35.47 
 
 		 418 aa  91.3  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000029957  normal  0.0111859 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1862  hypothetical protein  39.47 
 
 		 418 aa  91.3  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000261063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1878  hypothetical protein  39.47 
 
 		 418 aa  91.3  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000220122  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1533  hypothetical protein  35.18 
 
 		 418 aa  90.9  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000116235  hitchhiker  0.00188577 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01625  hypothetical protein  39.47 
 
 		 418 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01635  hypothetical protein  39.47 
 
 		 418 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.629129  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  26.26 
 
 		 1070 aa  89  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  26.83 
 
 		 1070 aa  87  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  31.56 
 
 		 1763 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  31.56 
 
 		 1762 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  31.56 
 
 		 1762 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  26.51 
 
 		 819 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  26.36 
 
 		 825 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  43.93 
 
 		 914 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  25.59 
 
 		 924 aa  72.4  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  26.9 
 
 		 1741 aa  72  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  44.95 
 
 		 864 aa  72  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.98 
 
 		 1357 aa  69.3  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  29.82 
 
 		 909 aa  68.6  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  25.99 
 
 		 1234 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  49.52 
 
 		 1009 aa  64.7  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.34 
 
 		 1197 aa  63.9  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  35.43 
 
 		 1049 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  39.05 
 
 		 927 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  31.73 
 
 		 1571 aa  59.3  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  32.77 
 
 		 818 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  29.36 
 
 		 1068 aa  57.8  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  24.71 
 
 		 950 aa  56.2  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  24.25 
 
 		 1971 aa  55.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  24.76 
 
 		 989 aa  55.1  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3373  YadA domain protein  44 
 
 		 3635 aa  54.7  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000846047 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  25.14 
 
 		 1593 aa  53.9  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  27.02 
 
 		 1268 aa  53.9  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  24.75 
 
 		 1012 aa  54.3  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  24.54 
 
 		 2926 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.95 
 
 		 1055 aa  53.5  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  25.81 
 
 		 1108 aa  52.8  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.06 
 
 		 1023 aa  52  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  28.07 
 
 		 1285 aa  52  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  24.27 
 
 		 820 aa  51.6  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  27 
 
 		 1254 aa  50.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  30.43 
 
 		 995 aa  51.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  27.85 
 
 		 1259 aa  50.4  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  27 
 
 		 1269 aa  50.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  37.25 
 
 		 2057 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  27.16 
 
 		 4312 aa  50.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  26.6 
 
 		 1259 aa  49.3  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  27.14 
 
 		 4391 aa  47.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3908  putative autotransporter  39.34 
 
 		 1472 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  30.15 
 
 		 1028 aa  46.6  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3892  putative autotransporter  37.1 
 
 		 1446 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  22.82 
 
 		 1594 aa  46.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  25.62 
 
 		 1252 aa  45.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  25.93 
 
 		 815 aa  45.8  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  29.18 
 
 		 1441 aa  45.4  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  31.62 
 
 		 773 aa  45.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  45.45 
 
 		 5613 aa  45.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5560  YadA domain protein  52.5 
 
 		 2396 aa  44.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.503173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  39 
 
 		 1254 aa  44.7  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>