More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0641 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
381 aa  763  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  53.91 
 
 
382 aa  417  1e-115  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.21 
 
 
386 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.82436e-09  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  52.25 
 
 
369 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  51.44 
 
 
379 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  4.2799e-08 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.38 
 
 
386 aa  355  6e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.96 
 
 
384 aa  347  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.55 
 
 
375 aa  336  3e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  46.72 
 
 
400 aa  337  3e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  44.7 
 
 
476 aa  302  7e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  48.92 
 
 
500 aa  301  1e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  48.46 
 
 
388 aa  293  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.48342e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  44.47 
 
 
476 aa  291  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  48.59 
 
 
471 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  42.12 
 
 
474 aa  285  1e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  43.62 
 
 
476 aa  284  2e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  43.09 
 
 
472 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  47.43 
 
 
476 aa  281  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  46.51 
 
 
476 aa  279  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  7.81376e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  44.44 
 
 
411 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  47.06 
 
 
478 aa  275  1e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  44.6 
 
 
473 aa  273  4e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  46.73 
 
 
464 aa  269  6e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.6609e-07  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  44.93 
 
 
469 aa  268  8e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  43.95 
 
 
464 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.55 
 
 
385 aa  266  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  45.61 
 
 
505 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  45.56 
 
 
387 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  45.37 
 
 
481 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  44.07 
 
 
380 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  45.11 
 
 
474 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  45.07 
 
 
475 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  45.27 
 
 
388 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  45.92 
 
 
452 aa  263  4e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  45.72 
 
 
402 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  42.08 
 
 
487 aa  262  7e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  45.43 
 
 
401 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.41 
 
 
398 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  43.75 
 
 
474 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.43 
 
 
401 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  45.43 
 
 
402 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  44.94 
 
 
482 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  45.43 
 
 
402 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.05 
 
 
428 aa  261  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  45.43 
 
 
402 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.46 
 
 
379 aa  260  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.67 
 
 
401 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  44.65 
 
 
465 aa  260  3e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  47.68 
 
 
457 aa  260  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  43.49 
 
 
503 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.67 
 
 
401 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  44.67 
 
 
401 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.67 
 
 
401 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  43.17 
 
 
389 aa  259  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  45.43 
 
 
402 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  43.73 
 
 
411 aa  259  5e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  37.6 
 
 
383 aa  259  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  43.82 
 
 
403 aa  259  8e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0105  protease Do  42.07 
 
 
489 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  42.86 
 
 
389 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  45.09 
 
 
503 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  37.24 
 
 
415 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  41.49 
 
 
478 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  44.67 
 
 
388 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  45.29 
 
 
402 aa  257  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  43.06 
 
 
518 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  43.47 
 
 
408 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  40 
 
 
389 aa  257  3e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2422  peptidase S1C, Do  43.73 
 
 
501 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  44.24 
 
 
480 aa  256  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  43.16 
 
 
408 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  45.24 
 
 
459 aa  256  5e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  43.27 
 
 
506 aa  256  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  45.24 
 
 
459 aa  256  6e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  38.58 
 
 
498 aa  256  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  43.15 
 
 
496 aa  255  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  42.2 
 
 
495 aa  255  7e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  42.12 
 
 
386 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  43.07 
 
 
407 aa  256  7e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  41.19 
 
 
385 aa  255  8e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  42.9 
 
 
407 aa  254  2e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  38.22 
 
 
474 aa  254  2e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  38.22 
 
 
474 aa  254  2e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  43.12 
 
 
464 aa  254  2e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  44.18 
 
 
479 aa  254  2e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  41.19 
 
 
477 aa  254  2e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  41.32 
 
 
506 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  42.12 
 
 
386 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  42.55 
 
 
386 aa  253  4e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.15 
 
 
475 aa  253  4e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  43.32 
 
 
473 aa  253  4e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  41.32 
 
 
493 aa  253  4e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  44.83 
 
 
398 aa  253  5e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  42.73 
 
 
403 aa  253  5e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  39.6 
 
 
509 aa  253  5e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  42.01 
 
 
424 aa  252  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  45.96 
 
 
453 aa  252  7e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  41.82 
 
 
402 aa  252  8e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.29 
 
 
412 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  43.62 
 
 
483 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>