More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0702 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0702  UspA domain protein  100 
 
 		 282 aa  577  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  30.74 
 
 		 288 aa  132  9e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  28.62 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  29.23 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  30 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  30.21 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  29.68 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1652  UspA domain protein  32.12 
 
 		 270 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.432641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  26.67 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3570  UspA domain protein  30.39 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610605 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  28.28 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  29.41 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  32.51 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  27.78 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  28.01 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  26.71 
 
 		 415 aa  82.8  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  25.25 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  39.31 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  29.11 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  38.96 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  27.99 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 148 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  33.79 
 
 		 145 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0502  UspA domain protein  30.24 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  25.65 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2887  UspA domain-containing protein  29.27 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.92135 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 145 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  27.65 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  28.25 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  33.57 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  33.78 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  27.51 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  30.82 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  29.17 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  35.21 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  29.58 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  32.88 
 
 		 151 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2708  UspA domain-containing protein  26.03 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0505017  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  32.03 
 
 		 314 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  33.11 
 
 		 145 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  36.62 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5529  UspA domain protein  24.73 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0897314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  27.59 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  26.69 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0640  universal stress protein  22.52 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  27.62 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  32.62 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  25.78 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  26.4 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_002936  DET0674  universal stress protein  23.6 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  27.66 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  30.34 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  31.9 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.9 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  27.21 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4252  UspA domain protein  24.61 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_580  universal stress protein family  21.19 
 
 		 287 aa  62  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  28.23 
 
 		 280 aa  62  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  28.92 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  34.72 
 
 		 146 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.5 
 
 		 152 aa  62  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  32.52 
 
 		 169 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 145 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  31.08 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  31.29 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.9 
 
 		 155 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  29.17 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  31.76 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0612  UspA domain-containing protein  25.12 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02880  hypothetical protein  25.36 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  31.29 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  26.55 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  32.64 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  27.35 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  35.29 
 
 		 148 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  32.43 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  30.46 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  34.27 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0875  UspA domain-containing protein  29.93 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  28.98 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  32.5 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4000  hypothetical protein  33.56 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  32.41 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4367  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  31.08 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5987  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  32.17 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  33.57 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  31.48 
 
 		 156 aa  58.5  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  30.82 
 
 		 153 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 145 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>