281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0858 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0858  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 439 aa  897    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000315652  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0278  WD40 domain-containing protein  63.93 
 
 		 463 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  65.05 
 
 		 446 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  53.15 
 
 		 441 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  44.44 
 
 		 439 aa  365  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  43.78 
 
 		 437 aa  361  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  28.28 
 
 		 443 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  29.55 
 
 		 457 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.02 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.72 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  29.87 
 
 		 440 aa  150  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  27.27 
 
 		 449 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.5 
 
 		 444 aa  143  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.77 
 
 		 429 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.67 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  25.74 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  28.41 
 
 		 429 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  26.7 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  34.15 
 
 		 445 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  29.17 
 
 		 441 aa  136  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  29.19 
 
 		 442 aa  136  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  28.54 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  26.58 
 
 		 440 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  28.18 
 
 		 426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  27.38 
 
 		 443 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.73 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  27.16 
 
 		 440 aa  131  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  27.46 
 
 		 425 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  29.45 
 
 		 441 aa  129  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  26.3 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  25.68 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.68 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.43 
 
 		 407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  27.68 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  26.5 
 
 		 427 aa  124  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  29.65 
 
 		 421 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  27.1 
 
 		 421 aa  124  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  27.29 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  27.62 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  25.78 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  29.02 
 
 		 437 aa  120  4.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  29.02 
 
 		 440 aa  120  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1068  translocation protein TolB  26.84 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.360403  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  24.31 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  27.25 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  27.25 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  25.72 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  26.54 
 
 		 427 aa  117  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  28.47 
 
 		 441 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0949  translocation protein TolB  26.55 
 
 		 474 aa  116  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.400419  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  28.34 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  27.25 
 
 		 430 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  26.87 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  27.51 
 
 		 428 aa  113  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  27.99 
 
 		 437 aa  113  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  28.48 
 
 		 444 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  26.9 
 
 		 432 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  25.9 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  29.05 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  29.64 
 
 		 431 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  29.64 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  29.64 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  29.64 
 
 		 431 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  26.09 
 
 		 451 aa  110  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  26.59 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  26.59 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  26.59 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  28.93 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  26.45 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  29.29 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00700  translocation protein TolB precursor  27.39 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000197077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2895  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.39 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000023315  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  27.06 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  27.06 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  27.06 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0662  translocation protein TolB  27.39 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000673794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0843  translocation protein TolB  27.39 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000968933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  27.06 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2915  translocation protein TolB  27.39 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000243248  normal  0.51862 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  27.06 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  22.52 
 
 		 403 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0763  translocation protein TolB  27.39 
 
 		 431 aa  108  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000112892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00689  hypothetical protein  27.39 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000219845  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0769  translocation protein TolB  27.39 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000591343  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  26.71 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1529  TolB protein  26.8 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  27.3 
 
 		 442 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  27.3 
 
 		 442 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  27.3 
 
 		 442 aa  107  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1454  TolB protein  26.8 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  26.28 
 
 		 442 aa  106  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  24.92 
 
 		 451 aa  106  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  27.3 
 
 		 442 aa  106  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  26.3 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  25.43 
 
 		 463 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1279  translocation protein TolB  27.39 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000335238  decreased coverage  0.00000521877 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1699  translocation protein TolB  24.26 
 
 		 442 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  25.14 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  25.14 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  25.14 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>