67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1305 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  100 
 
 
246 aa  500  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1476  general secretion pathway protein J  65.02 
 
 
237 aa  330  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  61.38 
 
 
216 aa  238  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  60.85 
 
 
216 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0009  general secretion pathway protein J  50.76 
 
 
199 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.264866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4585  general secretion pathway protein J  42.36 
 
 
219 aa  156  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001886  general secretion pathway protein J  39.25 
 
 
225 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00607  general secretion pathway protein J  40.51 
 
 
250 aa  148  9e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0172  general secretion pathway protein J  36.29 
 
 
255 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  38.71 
 
 
241 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0111  general secretion pathway protein J  38.81 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0103  general secretion pathway protein J  39.9 
 
 
211 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2300  general secretion pathway protein J  40 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0127  general secretion pathway protein J  40.74 
 
 
251 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4200  general secretion pathway protein J  36.84 
 
 
263 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0159  general secretion pathway protein J  37.84 
 
 
259 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0159  general secretion pathway protein J  37.84 
 
 
259 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0162  general secretion pathway protein J  35.51 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3613  general secretion pathway protein J  40.1 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0155  general secretion pathway protein J  35.46 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4352  general secretion pathway protein J  40.1 
 
 
250 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4728  general secretion pathway protein J  41.36 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  40.2 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0157  general secretion pathway protein J  38.31 
 
 
253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3561  general secretion pathway protein J  35.89 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2918  general secretion pathway protein J  36.99 
 
 
215 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0157  general secretion pathway protein J  37.44 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4245  general secretion pathway protein J  40.82 
 
 
197 aa  125  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0360831 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24060  general secretion pathway protein J  37.04 
 
 
237 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2035  general secretion pathway protein J  35.94 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3241  general secretion pathway protein GspJ  36.68 
 
 
201 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.575634 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3132  general secretion pathway protein J  36.18 
 
 
201 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3406  general secretion pathway protein GspJ  35.18 
 
 
199 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3421  general secretion pathway protein J  35.18 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0237  general secretion pathway protein J  34.3 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03962  general secretion pathway protein J  32.51 
 
 
208 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2920  general secretion pathway protein J  36.73 
 
 
239 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.34948  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02782  hypothetical protein  34.76 
 
 
189 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000034032  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02832  hypothetical type II secretion protein GspJ  35.14 
 
 
187 aa  99  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000053878  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1354  general secretion pathway protein J  30.59 
 
 
254 aa  98.6  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1010  general secretion pathway protein J  29.29 
 
 
198 aa  90.1  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0958  general secretion pathway protein J  28.79 
 
 
198 aa  87.8  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.83965  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3574  general secretion pathway protein J  28.86 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.629666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1410  general secretion pathway protein J  33.33 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0118952  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1385  general secretion pathway protein J  33.12 
 
 
198 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.44929  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1313  type II secretory pathway protein LspJ  24.49 
 
 
205 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3310  Type II secretory pathway component PulJ-like protein  26.04 
 
 
181 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2388  general secretion pathway protein J  30.7 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000292779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0256  general secretion pathway protein J  34.16 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.745018  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1310  type II secretory pathway protein LspJ  24.49 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0147  general secretion pathway protein J  25.53 
 
 
253 aa  55.8  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3264  general secretion pathway protein J  29.36 
 
 
131 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089395  hitchhiker  0.00000000000000309054 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1528  general secretion pathway protein J  42.42 
 
 
291 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81636  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3525  general secretion pathway protein J  27.31 
 
 
195 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0382  general secretion pathway protein J  28.24 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03133  hypothetical protein  28.24 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03182  predicted general secretory pathway component, cryptic  28.24 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0382  general secretion pathway protein J  28.24 
 
 
195 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2580  hypothetical protein  36.76 
 
 
202 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214724  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0387  prepilin-type cleavage/methylation-like protein  28.74 
 
 
220 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.618821 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0234  general secretion pathway protein J  26.67 
 
 
193 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2375  general secretion pathway protein J  29.45 
 
 
223 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.69272  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3047  general secretory pathway J transmembrane protein  31.15 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.353213  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3196  hypothetical protein  27.75 
 
 
202 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114017  hitchhiker  0.00348326 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3551  hypothetical protein  35.44 
 
 
184 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3394  putative general secretory pathway J transmembrane protein  31.67 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3109  general secretory pathway J transmembrane protein  31.67 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388678  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>