More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1044 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  50.41 
 
 		 742 aa  696    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  100 
 
 		 726 aa  1491    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  50.86 
 
 		 681 aa  665    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  50.43 
 
 		 694 aa  673    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  50.84 
 
 		 710 aa  691    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  50.7 
 
 		 706 aa  691    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  44.2 
 
 		 720 aa  588  1e-167  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  44.57 
 
 		 709 aa  574  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  43.2 
 
 		 728 aa  538  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  42.42 
 
 		 715 aa  528  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  42.2 
 
 		 706 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  40.5 
 
 		 700 aa  519  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  42.2 
 
 		 706 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  40.91 
 
 		 700 aa  520  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  42.2 
 
 		 706 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  42.2 
 
 		 706 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  42.2 
 
 		 721 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  40.5 
 
 		 700 aa  519  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  40.91 
 
 		 700 aa  520  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  40.22 
 
 		 700 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  40.63 
 
 		 700 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  40.5 
 
 		 700 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  40.22 
 
 		 700 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  40.22 
 
 		 700 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  40.69 
 
 		 705 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  40.44 
 
 		 736 aa  477  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  41.26 
 
 		 712 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 731 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  37.11 
 
 		 706 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  40.98 
 
 		 697 aa  463  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  37.2 
 
 		 701 aa  449  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  40.32 
 
 		 743 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  38.8 
 
 		 723 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  38.44 
 
 		 723 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 688 aa  332  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 675 aa  306  9.000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 705 aa  266  1e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 678 aa  246  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  30.25 
 
 		 691 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 680 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 700 aa  159  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 703 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 791 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 726 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  26.58 
 
 		 797 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  22.36 
 
 		 701 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 780 aa  134  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 742 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 681 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 696 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  24.05 
 
 		 727 aa  129  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 736 aa  126  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 770 aa  125  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 		 715 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 705 aa  123  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 734 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 678 aa  121  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 681 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 682 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 717 aa  118  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0279  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 730 aa  117  8.999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.874959  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0781  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 757 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 713 aa  115  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 737 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 718 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 702 aa  110  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  24.36 
 
 		 690 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 706 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 716 aa  107  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  24.18 
 
 		 717 aa  105  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 828 aa  104  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2804  outer membrane receptor protein  24.75 
 
 		 692 aa  103  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 836 aa  102  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 779 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 704 aa  99.4  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 795 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 855 aa  97.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 		 855 aa  97.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 787 aa  97.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 698 aa  97.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  23.32 
 
 		 659 aa  96.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 815 aa  95.9  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 714 aa  95.5  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  25.04 
 
 		 712 aa  94.4  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 739 aa  94  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  22.65 
 
 		 700 aa  92.8  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 795 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  24.77 
 
 		 723 aa  92  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  22.77 
 
 		 692 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  30.65 
 
 		 646 aa  90.9  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 711 aa  90.5  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0121  TonB-dependent receptor  21.83 
 
 		 681 aa  90.5  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.138382 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 792 aa  89.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 863 aa  89.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 698 aa  89.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 657 aa  88.2  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 702 aa  88.2  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 858 aa  87.8  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0687  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 772 aa  87.4  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0159  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 709 aa  86.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>