More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4525 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
165 aa  327  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
172 aa  144  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  51.43 
 
 
157 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  50.71 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  52.8 
 
 
167 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  48.87 
 
 
183 aa  121  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1789  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 
163 aa  112  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
157 aa  107  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
153 aa  104  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  42.75 
 
 
159 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
155 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  38.51 
 
 
154 aa  100  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 
168 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1502  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
163 aa  98.2  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.33868  normal  0.755413 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 
172 aa  96.7  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  34.75 
 
 
175 aa  94.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 
168 aa  93.6  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
152 aa  90.9  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  36.64 
 
 
153 aa  90.9  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
176 aa  90.5  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  36.49 
 
 
194 aa  90.1  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0030  MarR family transcriptional regulator  43.8 
 
 
233 aa  88.6  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 
157 aa  87.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  39.23 
 
 
149 aa  87.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  37.34 
 
 
166 aa  87  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  36.17 
 
 
158 aa  86.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  48.62 
 
 
156 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  36.11 
 
 
197 aa  85.9  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2894  transcriptional regulator, MarR family  37.98 
 
 
155 aa  85.5  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.943372  normal  0.111651 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  33.56 
 
 
155 aa  85.1  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  44.34 
 
 
142 aa  85.1  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  44.34 
 
 
128 aa  85.1  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14940  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 
182 aa  85.1  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  40.52 
 
 
166 aa  84.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  41.18 
 
 
164 aa  84.7  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 
165 aa  84.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  32.62 
 
 
151 aa  84.3  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2457  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00103329  normal  0.114009 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  35.86 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  43.81 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  42.2 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  44.57 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  43.27 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 
161 aa  80.5  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  43.81 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  38.85 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  39.34 
 
 
154 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
197 aa  79  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  37.07 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  36.22 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  38.84 
 
 
140 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  34.06 
 
 
160 aa  77  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3088  transcriptional regulator, MarR family  34.75 
 
 
180 aa  77  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  36.43 
 
 
160 aa  76.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  35.04 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3552  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0984354 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4472  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1155  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1172  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.247959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1182  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.937624  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 
170 aa  74.7  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  37.6 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1721  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3506  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
189 aa  73.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3861  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.611772  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  40.37 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3739  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
163 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.394554  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 
171 aa  70.9  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1008  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 
151 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153895  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>