More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1029 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  70.05 
 
 		 214 aa  293  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  65.53 
 
 		 223 aa  287  1e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1510  dTMP kinase  67 
 
 		 219 aa  284  7e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1638  thymidylate kinase  64.71 
 
 		 219 aa  277  8e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1611  dTMP kinase  64.04 
 
 		 217 aa  263  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  58.65 
 
 		 222 aa  246  2e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  44.66 
 
 		 203 aa  195  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  45.89 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  45.93 
 
 		 207 aa  185  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  48.28 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  41.35 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  46.53 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  42.38 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0498  dTMP kinase  41.23 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  42.58 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  42.52 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  43.96 
 
 		 212 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0158  thymidylate kinase  44.44 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  45.54 
 
 		 199 aa  169  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  42.31 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_684  thymidylate kinase  46.15 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  41.43 
 
 		 212 aa  168  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  41.87 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  42.99 
 
 		 210 aa  167  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  40.64 
 
 		 215 aa  167  9e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0704  thymidylate kinase  45.41 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1644  dTMP kinase  46.12 
 
 		 197 aa  166  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  40.38 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  40.78 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0778  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0683  thymidylate kinase  43.75 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01471  thymidylate kinase  42.79 
 
 		 212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.702638  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01491  thymidylate kinase  43.27 
 
 		 212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  42.03 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  40.09 
 
 		 216 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  40.19 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  44.17 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0132  thymidylate kinase  42.31 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0424228  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0787  dTMP kinase  43.2 
 
 		 207 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  42.79 
 
 		 197 aa  162  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24870  thymidylate kinase  39.52 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  40.27 
 
 		 233 aa  161  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3232  dTMP kinase  41.26 
 
 		 226 aa  161  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  39.81 
 
 		 204 aa  161  9e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1461  dTMP kinase  43.07 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2940  dTMP kinase  41.35 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3720  dTMP kinase  41.63 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484768 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  38.35 
 
 		 688 aa  159  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  41.36 
 
 		 213 aa  157  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  37.79 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0843  dTMP kinase  40.1 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.224695 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1275  thymidylate kinase  41.75 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  39.9 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  46.11 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  38.53 
 
 		 707 aa  154  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1575  thymidylate kinase  39.91 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2380  thymidylate kinase  42.93 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.723503  normal  0.922007 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  45.36 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0717  thymidylate kinase  38.6 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  40 
 
 		 219 aa  152  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  41.92 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01581  thymidylate kinase  40.38 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.978183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  39.32 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  38.28 
 
 		 209 aa  150  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  41.97 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0010  thymidylate kinase  40.49 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.852172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0609  thymidylate kinase  39.23 
 
 		 225 aa  149  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0198408  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  44.21 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 671 aa  148  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  39.9 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  39.55 
 
 		 234 aa  148  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1128  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 209 aa  147  9e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0445  thymidylate kinase  39.02 
 
 		 211 aa  147  9e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  37.93 
 
 		 901 aa  147  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  41.36 
 
 		 222 aa  147  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  38.46 
 
 		 705 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  37.02 
 
 		 703 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  40 
 
 		 686 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  41.12 
 
 		 240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0121  thymidylate kinase  37.93 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.505241  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  39.02 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4954  thymidylate kinase  41.83 
 
 		 707 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26491  thymidylate kinase  37.27 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  38.81 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0922  dTMP kinase  41.43 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  41.33 
 
 		 209 aa  145  6e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26170  thymidylate kinase  39.15 
 
 		 243 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288155  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  38.12 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  40.62 
 
 		 686 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  39.69 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0027  dTMP kinase  41.43 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.59116  normal  0.0709229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  41.79 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  37.5 
 
 		 244 aa  141  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2144  dTMP kinase  40.1 
 
 		 199 aa  141  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1277  thymidylate kinase  41.55 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.431831 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0526  thymidylate kinase  42.35 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09210  thymidylate kinase  41.08 
 
 		 295 aa  141  8e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0808366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>