77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2191 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2191  Rhomboid family protein  100 
 
 		 262 aa  529  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07080  putative transmembrane rhomboid family protein  30.88 
 
 		 299 aa  125  5e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0209  rhomboid family protein  31.58 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0277  Rhomboid family protein  29.69 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.499185  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0483  Rhomboid family protein  29.79 
 
 		 286 aa  108  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6620  Rhomboid family protein  31.47 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000794004  hitchhiker  0.00987109 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0016  hypothetical protein  29.34 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3809  Rhomboid family protein  28.47 
 
 		 304 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.199592 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1654  hypothetical protein  26.24 
 
 		 302 aa  96.3  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1403  rhomboid family protein  29.01 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.327287 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2536  Rhomboid family protein  32.74 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2277  Rhomboid family protein  29.87 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0857  rhomboid-like protein  35.09 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00124204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5567  Rhomboid family protein  26.85 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0043  hypothetical protein  28.83 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0498442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  26.07 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  27.03 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2735  rhomboid family protein  28.44 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.77359  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2907  Rhomboid family protein  30 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0787  Rhomboid family protein  26.82 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2124  hypothetical protein  27.4 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0205  rhomboid protein  32.68 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0326633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1301  rhomboid family protein  28.06 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  27.64 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1588  Rhomboid family protein  25.4 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  27.06 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  31.08 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  26.47 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5920  rhomboid family protein  28.4 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144977  normal  0.337945 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1299  serine protease  27.65 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  29.53 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  29.78 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  30.14 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1458  Rhomboid family protein  27.33 
 
 		 211 aa  52.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  26.12 
 
 		 280 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  25 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  28.39 
 
 		 224 aa  50.4  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1572  S54 family peptidase  27.45 
 
 		 260 aa  50.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.013038  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1485  S54 family peptidase  27.45 
 
 		 260 aa  49.7  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  25 
 
 		 376 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2019  rhomboid family protein  26.05 
 
 		 226 aa  49.3  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.334479  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_139  rhomboid  28.04 
 
 		 190 aa  48.9  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0073  peptidase  27.45 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104712  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3853  Rhomboid family protein  27.7 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4665  rhomboid-like protein  30.46 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.545556 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3560  Rhomboid family protein  27.4 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.27249 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  27.43 
 
 		 541 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13218  hypothetical protein  27.94 
 
 		 216 aa  47  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1039  serine protease  27.45 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.224714  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0391  S54 family peptidase  27.45 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0021  S54 family peptidase  27.45 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1192  S54 family peptidase  27.45 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.970208  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0124  rhomboid family protein  29.75 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3032  rhomboid-like protein  29.03 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.646386  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1772  hypothetical protein  27.48 
 
 		 238 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.884699 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  25.47 
 
 		 569 aa  45.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  26.06 
 
 		 226 aa  45.8  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  22.87 
 
 		 298 aa  45.4  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  23.33 
 
 		 243 aa  45.4  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  27.93 
 
 		 486 aa  45.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8424  predicted protein  25.15 
 
 		 160 aa  45.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.339927  normal  0.0315766 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5314  rhomboid family protein  27.54 
 
 		 496 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.63242 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0239  rhomboid family protein  26.23 
 
 		 190 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  24.86 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1552  Rhomboid family protein  27.78 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000315131 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  29.58 
 
 		 513 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_002936  DET0132  rhomboid family protein  25.18 
 
 		 190 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0904  rhomboid family protein  25.28 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5548  Rhomboid family protein  26.45 
 
 		 198 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0778424  normal  0.596503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  28.05 
 
 		 579 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  23.27 
 
 		 360 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0860  Rhomboid family protein  24.84 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  25 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  26.75 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  28.37 
 
 		 386 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0176  membrane-associated serine protease  28.49 
 
 		 230 aa  42.4  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0001752  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0165  Rhomboid family protein  25.15 
 
 		 292 aa  42  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>