More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1804 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1804  major facilitator transporter  100 
 
 		 470 aa  940    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000239079  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  66.45 
 
 		 483 aa  619  1e-176  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1813  major facilitator transporter  56.38 
 
 		 480 aa  512  1e-144  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 514 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 475 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 475 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 475 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0113  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 499 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 475 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  25.06 
 
 		 454 aa  145  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 496 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  30.02 
 
 		 489 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  30.02 
 
 		 489 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  30.02 
 
 		 489 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  29.79 
 
 		 489 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 493 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1045  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 478 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4136  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 477 aa  103  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4107  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 477 aa  103  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.338047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1122  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 482 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  24.89 
 
 		 480 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4363  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  27.23 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 460 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4579  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 487 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  26.67 
 
 		 446 aa  98.2  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.11 
 
 		 450 aa  97.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  30.99 
 
 		 475 aa  96.7  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 452 aa  96.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 452 aa  95.1  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1117  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.316307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  26.58 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2083  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 507 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.835156  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 457 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 490 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  27.51 
 
 		 493 aa  86.7  9e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2459  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  25.72 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 467 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5446  putative MFS superfamily transport protein  25.11 
 
 		 484 aa  83.2  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  26.64 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  28.96 
 
 		 471 aa  81.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  26.12 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  0.0000000000014456 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  25 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5722  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.731406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  23.37 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  27.95 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  28.05 
 
 		 480 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  25.85 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 487 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  27.92 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 487 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5716  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  26.07 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 485 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  25.9 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  28.02 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  26.67 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 479 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01738  predicted transporter  22.84 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.375088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01726  hypothetical protein  22.84 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.448165  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  29.51 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  31 
 
 		 480 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  25.75 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1993  major facilitator family transporter  22.84 
 
 		 452 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.863885  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1873  major facilitator superfamily MFS_1  22.84 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0070319  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  25.99 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  29.17 
 
 		 474 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.55 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1853  major facilitator family transporter  22.84 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0220731  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2490  inner membrane metabolite transport protein YdjE  22.84 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.754275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  28.33 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>