More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2459 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1122  major facilitator transporter  76.38 
 
 
482 aa  718    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2459  major facilitator transporter  100 
 
 
471 aa  935    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2083  major facilitator transporter  73.55 
 
 
507 aa  693    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.835156  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4579  major facilitator transporter  73.19 
 
 
487 aa  708    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5446  putative MFS superfamily transport protein  77.45 
 
 
484 aa  723    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4363  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 
478 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  30.7 
 
 
454 aa  230  4e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  30.11 
 
 
489 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  29.89 
 
 
489 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  29.89 
 
 
489 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  29.68 
 
 
489 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1045  major facilitator transporter  26.64 
 
 
478 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  27.93 
 
 
493 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  28.97 
 
 
514 aa  162  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4107  major facilitator transporter  28.88 
 
 
477 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.338047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4136  major facilitator transporter  28.88 
 
 
477 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  27.18 
 
 
496 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  28.51 
 
 
475 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  28.82 
 
 
475 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  28.82 
 
 
475 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  28.82 
 
 
475 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0113  major facilitator transporter  27.08 
 
 
499 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  25.45 
 
 
476 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  25.18 
 
 
445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  25.92 
 
 
452 aa  107  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  27.16 
 
 
480 aa  106  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  25.12 
 
 
438 aa  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  26.02 
 
 
443 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  26.21 
 
 
443 aa  101  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  26.28 
 
 
446 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  26.21 
 
 
443 aa  100  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  26.21 
 
 
443 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 
443 aa  100  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  26.21 
 
 
443 aa  100  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  26.21 
 
 
443 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  26.21 
 
 
443 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  26.56 
 
 
464 aa  99.8  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  27.68 
 
 
442 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  26.51 
 
 
458 aa  93.6  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  26.41 
 
 
468 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  27.34 
 
 
439 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  26.41 
 
 
468 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  26.41 
 
 
468 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  26.41 
 
 
468 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  26.41 
 
 
468 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  25.61 
 
 
443 aa  90.1  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  22.82 
 
 
427 aa  89.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  27.96 
 
 
442 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 
460 aa  87.4  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 
483 aa  86.7  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  26.08 
 
 
458 aa  85.9  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  26.08 
 
 
458 aa  85.9  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  27.37 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  25.94 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  20.83 
 
 
423 aa  83.2  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1804  major facilitator transporter  25.58 
 
 
470 aa  81.3  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000239079  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 
446 aa  77  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
448 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 
465 aa  75.1  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  23.15 
 
 
465 aa  75.1  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  25.23 
 
 
477 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1813  major facilitator transporter  21.7 
 
 
480 aa  74.3  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  25.8 
 
 
457 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 
508 aa  73.6  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  22.69 
 
 
480 aa  73.6  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9947  predicted protein  27.89 
 
 
439 aa  72.8  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  21.88 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 
451 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  25.06 
 
 
459 aa  70.9  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 
474 aa  70.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5143  major facilitator transporter  23.45 
 
 
482 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  23.48 
 
 
499 aa  70.5  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  26.12 
 
 
472 aa  70.1  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  24.46 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 
423 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  26.44 
 
 
492 aa  69.3  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  29.33 
 
 
472 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  29.05 
 
 
457 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5716  major facilitator transporter  25.89 
 
 
482 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  24.87 
 
 
459 aa  68.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3410  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
484 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  25.38 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  25.9 
 
 
490 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  23.94 
 
 
463 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  24.02 
 
 
452 aa  68.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  22.57 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 
472 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03490  sugar transporter, putative  26.32 
 
 
565 aa  67.4  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16128  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1863  major facilitator transporter  22.96 
 
 
452 aa  67.4  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.369973  hitchhiker  0.0000261137 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  24.02 
 
 
452 aa  67.4  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  27.24 
 
 
442 aa  67  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  25.12 
 
 
468 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  22.28 
 
 
447 aa  66.6  0.0000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  0.0000000000014456 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  24.02 
 
 
452 aa  66.6  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  22.55 
 
 
444 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  25 
 
 
477 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  27.11 
 
 
526 aa  66.6  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  23.86 
 
 
442 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1422  major facilitator family transporter  22.51 
 
 
452 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.452173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>