More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2083 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1122  major facilitator transporter  76.86 
 
 
482 aa  743    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2083  major facilitator transporter  100 
 
 
507 aa  1008    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.835156  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5446  putative MFS superfamily transport protein  78.51 
 
 
484 aa  752    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2459  major facilitator transporter  73.55 
 
 
471 aa  705    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4579  major facilitator transporter  94.25 
 
 
487 aa  917    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4363  major facilitator superfamily MFS_1  48.56 
 
 
478 aa  404  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  30.21 
 
 
454 aa  216  9e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  33.54 
 
 
489 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  33.33 
 
 
489 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  33.33 
 
 
489 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  33.13 
 
 
489 aa  195  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  29.94 
 
 
496 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1045  major facilitator transporter  30.66 
 
 
478 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  30 
 
 
514 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  30.25 
 
 
475 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  30.04 
 
 
475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  30.04 
 
 
475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  29.81 
 
 
475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  29.83 
 
 
493 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4136  major facilitator transporter  31.52 
 
 
477 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4107  major facilitator transporter  31.52 
 
 
477 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.338047  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0113  major facilitator transporter  28.96 
 
 
499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  27.91 
 
 
480 aa  116  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  27.37 
 
 
464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  24.55 
 
 
476 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  29.21 
 
 
438 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  26.73 
 
 
445 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  25.92 
 
 
442 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  27.96 
 
 
446 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  27.95 
 
 
458 aa  98.2  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.01 
 
 
468 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  27.01 
 
 
468 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  27.95 
 
 
458 aa  98.2  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  27.01 
 
 
468 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  27.01 
 
 
468 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  27.74 
 
 
468 aa  97.8  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  26.07 
 
 
452 aa  95.9  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  27.57 
 
 
442 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  28.08 
 
 
443 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  28.08 
 
 
443 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  28.08 
 
 
443 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 
443 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  28.08 
 
 
443 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1804  major facilitator transporter  27.02 
 
 
470 aa  95.1  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000239079  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  28.08 
 
 
443 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  28.08 
 
 
443 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  28.08 
 
 
443 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  25.44 
 
 
465 aa  88.2  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
465 aa  88.2  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  23.58 
 
 
427 aa  88.2  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  25.11 
 
 
459 aa  87.8  4e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  26.27 
 
 
469 aa  86.7  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  25.94 
 
 
471 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  25.4 
 
 
458 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  27.07 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
508 aa  81.3  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 
460 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  24.76 
 
 
439 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 
448 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 
483 aa  76.6  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5143  major facilitator transporter  23.28 
 
 
482 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  27.96 
 
 
472 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
451 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  28.47 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  24.37 
 
 
457 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3410  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
484 aa  73.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  28.62 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  24.65 
 
 
457 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  28 
 
 
526 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  28.62 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  29.3 
 
 
466 aa  71.6  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 
446 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  25.54 
 
 
480 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  24.88 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  25.85 
 
 
438 aa  71.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  28.1 
 
 
437 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  21.35 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00600  trehalose transport-related protein, putative  26.57 
 
 
563 aa  70.9  0.00000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.633366  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  24.65 
 
 
443 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
483 aa  70.9  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  22.74 
 
 
499 aa  70.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  26.48 
 
 
490 aa  70.5  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
460 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  25.13 
 
 
452 aa  70.1  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 
474 aa  70.5  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  23.58 
 
 
471 aa  69.7  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  24.79 
 
 
442 aa  69.7  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3220  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 
463 aa  69.7  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0542188  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  28.87 
 
 
487 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9947  predicted protein  26.42 
 
 
439 aa  69.7  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  28.87 
 
 
487 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  24.63 
 
 
443 aa  68.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  28.87 
 
 
487 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  25.13 
 
 
452 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  25.13 
 
 
452 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 
477 aa  68.2  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5083  major facilitator transporter  31.64 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418338  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.43 
 
 
463 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  24.37 
 
 
459 aa  67.8  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5716  major facilitator transporter  25.11 
 
 
482 aa  67.8  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>