More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4363 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4363  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
478 aa  947    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4579  major facilitator transporter  50.22 
 
 
487 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5446  putative MFS superfamily transport protein  50.22 
 
 
484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1122  major facilitator transporter  48.89 
 
 
482 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2459  major facilitator transporter  47.56 
 
 
471 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2083  major facilitator transporter  48.56 
 
 
507 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.835156  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  31.87 
 
 
454 aa  251  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1045  major facilitator transporter  34.76 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  31.55 
 
 
496 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0027  putative sugar transport protein  30.85 
 
 
489 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1518  major facilitator superfamily permease  30.41 
 
 
489 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28243  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  30.37 
 
 
475 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  30.37 
 
 
475 aa  186  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1172  MFS transporter  30.64 
 
 
489 aa  186  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.537598  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1432  major facilitator family transporter  30.64 
 
 
489 aa  186  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4136  major facilitator transporter  32.03 
 
 
477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4107  major facilitator transporter  32.03 
 
 
477 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.338047  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  30.93 
 
 
475 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2161  major facilitator transporter  30.15 
 
 
514 aa  183  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227484  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7502  major facilitator transporter  30.43 
 
 
475 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0253072  normal  0.395305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  31.47 
 
 
493 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0113  major facilitator transporter  29.57 
 
 
499 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  28.57 
 
 
464 aa  117  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  27.02 
 
 
443 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  26.41 
 
 
468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  25.12 
 
 
480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  26.41 
 
 
468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  26.41 
 
 
468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  26.41 
 
 
468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  26.41 
 
 
468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  26.88 
 
 
445 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  26.73 
 
 
443 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  26.1 
 
 
446 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  26.49 
 
 
443 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  26.49 
 
 
443 aa  107  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 
443 aa  107  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  26.49 
 
 
443 aa  107  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  26.49 
 
 
443 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  26.49 
 
 
443 aa  107  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  26.57 
 
 
443 aa  107  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
483 aa  106  9e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1804  major facilitator transporter  26.61 
 
 
470 aa  106  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000239079  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  27.43 
 
 
453 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 
460 aa  103  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  28.28 
 
 
458 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  28.28 
 
 
458 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  27.42 
 
 
438 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 
423 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  25.51 
 
 
452 aa  100  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  24.38 
 
 
427 aa  99  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  27.15 
 
 
457 aa  97.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  27.39 
 
 
442 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  25.53 
 
 
465 aa  96.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 
465 aa  96.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  26.06 
 
 
442 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  25.73 
 
 
452 aa  96.3  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  25.73 
 
 
452 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  25.73 
 
 
452 aa  95.1  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  25.78 
 
 
457 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  24.59 
 
 
458 aa  90.1  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
508 aa  87.8  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  25.96 
 
 
445 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  25.34 
 
 
499 aa  87  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  25.96 
 
 
445 aa  87  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 
469 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  25.96 
 
 
445 aa  87  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  25.96 
 
 
445 aa  87  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  24.15 
 
 
476 aa  87.4  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
448 aa  87  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  25.96 
 
 
445 aa  87  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  25.96 
 
 
445 aa  87  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
474 aa  87  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  25.77 
 
 
445 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  27.34 
 
 
480 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1813  major facilitator transporter  24.11 
 
 
480 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  24.31 
 
 
471 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  28.57 
 
 
497 aa  85.1  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  25.18 
 
 
441 aa  84.7  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  23.22 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  26.42 
 
 
468 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  25.39 
 
 
471 aa  82.4  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  23.08 
 
 
447 aa  81.6  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  0.0000000000014456 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  29.17 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 
483 aa  80.1  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  26.88 
 
 
468 aa  79.7  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5143  major facilitator transporter  26.77 
 
 
482 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  24.61 
 
 
480 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  25.78 
 
 
477 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 
456 aa  77.4  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  24.59 
 
 
477 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  25.42 
 
 
493 aa  76.6  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
479 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3410  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 
484 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5716  major facilitator transporter  25.2 
 
 
482 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  24.95 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  29.64 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  23.61 
 
 
444 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  26.84 
 
 
448 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9947  predicted protein  30.7 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>