More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3410 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3410  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 484 aa  955    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5143  major facilitator transporter  64.27 
 
 		 482 aa  593  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  60.38 
 
 		 484 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.24 
 
 		 451 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 447 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 435 aa  160  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 451 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  30.7 
 
 		 485 aa  152  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 432 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 447 aa  150  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.6 
 
 		 472 aa  150  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 432 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  28.41 
 
 		 477 aa  149  8e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 472 aa  149  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 474 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 438 aa  147  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 432 aa  146  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 434 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.96 
 
 		 462 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  27.9 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 473 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  27.8 
 
 		 467 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  28.39 
 
 		 459 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 435 aa  143  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 474 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 474 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.89 
 
 		 450 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 444 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 474 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 434 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  29.7 
 
 		 469 aa  139  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 473 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  27.17 
 
 		 476 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.98 
 
 		 461 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 445 aa  137  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  26.85 
 
 		 478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 478 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 470 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 459 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 478 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  26.91 
 
 		 455 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  26.27 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  25.06 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.72 
 
 		 474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 477 aa  133  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 		 456 aa  133  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  28.22 
 
 		 516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  26.84 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37250  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  26.84 
 
 		 399 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  26.58 
 
 		 399 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  26.58 
 
 		 399 aa  130  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  26.58 
 
 		 399 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  26.58 
 
 		 399 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.07 
 
 		 455 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  26.58 
 
 		 399 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  26.33 
 
 		 399 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.27 
 
 		 468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3197  MFS family transporter  26.09 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  26.21 
 
 		 399 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  27.21 
 
 		 428 aa  127  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  26.51 
 
 		 464 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 399 aa  127  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 467 aa  126  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3878  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 428 aa  126  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.957409 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  26.48 
 
 		 481 aa  126  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4812  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 433 aa  126  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.405857  hitchhiker  0.00118748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1072  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 434 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0970  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.29 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00262609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4578  major facilitator family transporter  26.36 
 
 		 428 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 398 aa  124  6e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1311  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 428 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00188583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  26.79 
 
 		 462 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 479 aa  123  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 479 aa  123  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 472 aa  123  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1875  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 459 aa  123  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.473892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>