295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0376 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  100 
 
 		 495 aa  1006    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  84.95 
 
 		 829 aa  528  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  77.66 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  51.74 
 
 		 497 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3531  Endo-1,4-beta-xylanase  66.08 
 
 		 472 aa  438  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  69.41 
 
 		 820 aa  438  1e-121  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  65.18 
 
 		 474 aa  432  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  68.25 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2487  Endo-1,4-beta-xylanase  66.77 
 
 		 815 aa  430  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.538992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4732  Endo-1,4-beta-xylanase  71.09 
 
 		 451 aa  428  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396836  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0245  glycoside hydrolase family 10  67.74 
 
 		 1001 aa  420  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  69.46 
 
 		 756 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2327  Endo-1,4-beta-xylanase  55.88 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.146279  hitchhiker  0.0000050608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05340  endo-1,4-beta-xylanase (glycosyl hydrolase family 10)  55.27 
 
 		 457 aa  344  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.536878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  38.52 
 
 		 490 aa  317  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0732  glycoside hydrolase family 10  44.33 
 
 		 503 aa  313  5.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.180847  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  53.21 
 
 		 474 aa  307  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  48.62 
 
 		 488 aa  299  6e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2923  xylanase  50.46 
 
 		 491 aa  296  7e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  44.64 
 
 		 678 aa  289  9e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  44.72 
 
 		 778 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  48.41 
 
 		 543 aa  271  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  40.77 
 
 		 487 aa  260  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0931  glycoside hydrolase family 10  41.59 
 
 		 423 aa  259  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.514764  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  45.05 
 
 		 477 aa  257  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  44.71 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  39.89 
 
 		 837 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1479  Endo-1,4-beta-xylanase  42.57 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0287  Endo-1,4-beta-xylanase  40 
 
 		 333 aa  236  9e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000028358  normal  0.661075 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03450  beta-1,4-xylanase  41.42 
 
 		 383 aa  232  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2791  xylanase  34.55 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01818  Endo-1,4-beta-xylanase C Precursor (Xylanase C)(EC 3.2.1.8)(1,4-beta-D-xylan xylanohydrolase C)(34 kDa xylanase)(Xylanase X34) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00177]  39.63 
 
 		 309 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.780963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2218  Endo-1,4-beta-xylanase  35.61 
 
 		 373 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000248753  decreased coverage  0.00000085459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0550  Endo-1,4-beta-xylanase  37.61 
 
 		 398 aa  215  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.45937  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0877  endo-1,4-beta-xylanase  39.18 
 
 		 347 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.113866  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0372  endo-1,4-beta-xylanase  38.46 
 
 		 389 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0854  endo-1,4-beta-xylanase  38.31 
 
 		 347 aa  212  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  73.29 
 
 		 507 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  70.63 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  39.38 
 
 		 628 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3986  Endo-1,4-beta-xylanase  35.06 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3547  Endo-1,4-beta-xylanase  37.29 
 
 		 376 aa  204  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0132087 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1112  Endo-1,4-beta-xylanase  37.07 
 
 		 328 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6584  Endo-1,4-beta-xylanase  37.84 
 
 		 375 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0793463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1647  Endo-1,4-beta-xylanase  35.58 
 
 		 323 aa  196  6e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.394588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  66.44 
 
 		 474 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  36.45 
 
 		 1041 aa  192  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0351  Endo-1,4-beta-xylanase  34.67 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1477  Endo-1,4-beta-xylanase  41.43 
 
 		 317 aa  190  5e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  34.49 
 
 		 1478 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  36.34 
 
 		 1037 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  66.67 
 
 		 520 aa  186  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0183  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  34.62 
 
 		 697 aa  186  8e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  37.46 
 
 		 1050 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0618  Endo-1,4-beta-xylanase  31.97 
 
 		 689 aa  182  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.687614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2633  endo-1,4-beta-xylanase  33.61 
 
 		 374 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112994  normal  0.315981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4240  Endo-1,4-beta-xylanase  34.78 
 
 		 324 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340306  normal  0.631707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0796  Endo-1,4-beta-xylanase  33.06 
 
 		 359 aa  180  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000650557  normal  0.101178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2934  endo-1,4-beta-xylanase  38.79 
 
 		 619 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000972759  normal  0.881694 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  34.38 
 
 		 1059 aa  177  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  34.38 
 
 		 1059 aa  177  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2710  Endo-1,4-beta-xylanase  37.15 
 
 		 331 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2657  endo-1,4-beta-xylanase  35.44 
 
 		 423 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.650838  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1400  endo-1,4-beta-xylanase  28.61 
 
 		 373 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0516827  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35732  Glycoside hydrolase, family 10 Endo-1,4-beta-xylanase precursor (Xylanase) Exoglucanase/xylanase precursor  34.49 
 
 		 321 aa  171  3e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3010  endo-1,4-beta-xylanase  32.17 
 
 		 321 aa  171  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.800055  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  59.31 
 
 		 691 aa  169  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1404  Endo-1,4-beta-xylanase  33.97 
 
 		 370 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478962  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2695  Endo-1,4-beta-xylanase  30.68 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44391  predicted protein  31.42 
 
 		 486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0416192  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2328  Endo-1,4-beta-xylanase  33.03 
 
 		 338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57061  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  59.72 
 
 		 466 aa  163  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4508  endo-1,4-beta-xylanase  34.46 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0185  Endo-1,4-beta-xylanase  30.37 
 
 		 337 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1996  endo-1,4-beta-xylanase  32.12 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  62.07 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3866  endo-1,4-beta-xylanase  34.16 
 
 		 463 aa  161  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0285247  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02356  beta-1,4-endoxylanase (Eurofung)  31.58 
 
 		 357 aa  160  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  34.11 
 
 		 1020 aa  160  6e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  32.7 
 
 		 1019 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  34.78 
 
 		 1018 aa  154  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2079  endo-1,4-beta-xylanase  32.21 
 
 		 364 aa  153  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3907  endo-1,4-beta-xylanase  32.26 
 
 		 392 aa  153  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124298  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  34.73 
 
 		 1495 aa  151  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1021  endo-1,4-beta-xylanase  32.43 
 
 		 388 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1132  Endo-1,4-beta-xylanase  31.58 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  32.39 
 
 		 1077 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0624  endo-1,4-beta-xylanase  30.03 
 
 		 756 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000271039  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2548  Endo-1,4-beta-xylanase  32.28 
 
 		 465 aa  147  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2227  endo-1,4-beta-xylanase  32.64 
 
 		 382 aa  146  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.470132  normal  0.0116576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2253  glycoside hydrolase family 10  34.65 
 
 		 381 aa  143  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1510  endo-1,4-beta-xylanase  30.23 
 
 		 520 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000764264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  33.64 
 
 		 2457 aa  141  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.62 
 
 		 770 aa  140  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  51.37 
 
 		 563 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6407  Endo-1,4-beta-xylanase  29.1 
 
 		 387 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.760258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  31.4 
 
 		 690 aa  134  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2108  endo-1,4-beta-xylanase  28.37 
 
 		 806 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3212  Endo-1,4-beta-xylanase  31.31 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.908141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  46.11 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>