More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4694 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4694  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2737  AraC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 262 aa  208  8e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0062511  hitchhiker  0.000065853 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000237  transcriptional regulator AraC family  39.15 
 
 		 246 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 228 aa  182  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2463  helix-turn-helix domain-containing protein  35.98 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  27.17 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2447  AraC family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  27.3 
 
 		 306 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  27.14 
 
 		 304 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1914  helix-turn-helix domain-containing protein  26.94 
 
 		 298 aa  89  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2016  transcriptional regulator, AraC family  28.01 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1069  hypothetical protein  34.31 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  27 
 
 		 277 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1875  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  24.09 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  24.51 
 
 		 244 aa  73.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  22.86 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1733  helix-turn-helix domain-containing protein  25.51 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0271524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1930  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  38.67 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 309 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2103  AraC family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  31.93 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.97 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4318  transcriptional regulator, AraC family  24.81 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.642666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 279 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  25.64 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  26.5 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  23.35 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  38.96 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  21.57 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  35.14 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  22.09 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  36.62 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  21.57 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  27.41 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  26.88 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  35.24 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 355 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  36.9 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 295 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2821  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  22.52 
 
 		 271 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  29.21 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1287  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400393 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 271 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0733  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.629568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 287 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1690  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 363 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  25.26 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  31.11 
 
 		 387 aa  52.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  30.95 
 
 		 339 aa  52.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  30.99 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  33.8 
 
 		 275 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4131  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 260 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  30.95 
 
 		 316 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6750  transcriptional regulator, AraC family  21.88 
 
 		 327 aa  52.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 331 aa  52.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8583  transcriptional regulator, AraC family  32.93 
 
 		 331 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2824  helix-turn-helix domain-containing protein  30.56 
 
 		 251 aa  52.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0253929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4602  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0287774  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  38.61 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 357 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 185 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 360 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 360 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 		 360 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 360 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 410 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0397  AraC/XylS family transcription factor  34.15 
 
 		 396 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4287  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 326 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 316 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>