More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1294 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  91.32 
 
 		 242 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4412  pentapeptide repeat-containing protein  56.93 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  49.33 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3960  pentapeptide repeat-containing protein  48.87 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  49.24 
 
 		 224 aa  182  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2222  pentapeptide repeat protein  34.98 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.011666  hitchhiker  0.000235255 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  30.7 
 
 		 381 aa  89.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  29.57 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  33.53 
 
 		 286 aa  81.6  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  29.82 
 
 		 734 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18320  uncharacterized low-complexity protein  32.56 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  29.76 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 		 401 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  34.62 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  29.11 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4774  pentapeptide repeat-containing protein  28.38 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4885  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 186 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  30.22 
 
 		 567 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  31.98 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  29.17 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  31.32 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  34.23 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  34.23 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  34.23 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  31.22 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  32.12 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  29.47 
 
 		 309 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1089  pentapeptide repeat-containing protein  28.64 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.820792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  30.41 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5070  pentapeptide repeat protein  32.22 
 
 		 174 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  27.32 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  33.53 
 
 		 521 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  30 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  27.73 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  31.61 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  31.34 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1540  pentapeptide repeat-containing protein  31.55 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  28.89 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  32.14 
 
 		 576 aa  72.4  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  33.13 
 
 		 363 aa  72.4  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  31.37 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0024  pentapeptide repeat-containing protein  28.24 
 
 		 949 aa  72.4  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  29.59 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0087  hypothetical protein  29.5 
 
 		 600 aa  72.4  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  29.73 
 
 		 278 aa  72  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  31.7 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  30.26 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  29.21 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  29.21 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  30.94 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  30.93 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  30.51 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0977  pentapeptide repeat-containing protein  28.02 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001517 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  29.6 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  29.47 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  30.14 
 
 		 447 aa  68.9  0.00000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  30.63 
 
 		 517 aa  68.9  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  29.21 
 
 		 976 aa  68.9  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1191 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  27.75 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  25.52 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  32.79 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  25.12 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4098  pentapeptide repeat-containing protein  31.32 
 
 		 710 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202207 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  26.04 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3347  pentapeptide repeat-containing protein  31.09 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  25.62 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  26.04 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  33.79 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  28.87 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  36.9 
 
 		 870 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  30.05 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  33.67 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  31 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2980  pentapeptide repeat-containing protein  26.96 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.497835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  27.43 
 
 		 332 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  29.86 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  34.21 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  27.86 
 
 		 386 aa  67  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  28.87 
 
 		 191 aa  67  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  29.83 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  30.57 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 453 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  25.52 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  29.67 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0995  pentapeptide repeat protein  30.18 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0411427 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  29.67 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  24.86 
 
 		 607 aa  66.6  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1033 aa  66.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0651  pentapeptide repeat protein  25.68 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  27.72 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26570  Pentapeptide repeat protein  32.76 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.146804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  26.94 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  31.03 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  30.89 
 
 		 493 aa  66.2  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  27.72 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>