More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1478 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  100 
 
 		 346 aa  713    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7660  outer membrane protein (porin)  87.57 
 
 		 366 aa  643    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0194748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  80.12 
 
 		 382 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  30.58 
 
 		 338 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  30.91 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  32.19 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  32.07 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  31.87 
 
 		 335 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  31.69 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  31.69 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  31.69 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2607  OmpC family outer membrane porin  31.37 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.782547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  31.35 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  30.29 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  31.4 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  30.22 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  28.42 
 
 		 344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  37.37 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  29.72 
 
 		 375 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  28.42 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  37.37 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  32.17 
 
 		 383 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  28.61 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  29.64 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  30.87 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  36.87 
 
 		 395 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  28.14 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  29.66 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  38.76 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  30.87 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  28.73 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  28.73 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1936  OmpC family outer membrane porin  31.27 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000467885  normal  0.0609572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  37.56 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  28.73 
 
 		 383 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  30.18 
 
 		 357 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  29.76 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  28.53 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  29.66 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  31.46 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5230  outer membrane protein, (porin)  29.61 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  32.4 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  36.06 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  28.21 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  37.88 
 
 		 378 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  38.28 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  27.98 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  30.54 
 
 		 354 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  28.65 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  27.98 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  36.06 
 
 		 430 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  36.06 
 
 		 430 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  30.61 
 
 		 354 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  30 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  30.61 
 
 		 354 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  27.47 
 
 		 356 aa  99.8  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  33.82 
 
 		 376 aa  99.8  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  30.55 
 
 		 351 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  30.28 
 
 		 372 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  31.2 
 
 		 362 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  27.83 
 
 		 396 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  35.58 
 
 		 430 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  31.74 
 
 		 374 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  35.58 
 
 		 430 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  35.58 
 
 		 430 aa  99.4  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  38.41 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  35.58 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  31.34 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  36.07 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  29.52 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  27.12 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  34.12 
 
 		 347 aa  97.8  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  29.17 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0973  OmpC family outer membrane porin  32.8 
 
 		 393 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000310087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  26.45 
 
 		 374 aa  97.8  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  35.52 
 
 		 398 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  34.3 
 
 		 390 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  36.23 
 
 		 386 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  38.79 
 
 		 387 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  38.18 
 
 		 392 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  38.18 
 
 		 392 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  32.56 
 
 		 376 aa  96.3  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  33.98 
 
 		 389 aa  96.7  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  34.3 
 
 		 390 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  30.29 
 
 		 390 aa  95.9  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  37.04 
 
 		 405 aa  95.9  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  36.84 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  27.04 
 
 		 369 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  34.76 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  38.25 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  28.46 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1917  porin  34.07 
 
 		 347 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  28.35 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  38.43 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  35.64 
 
 		 405 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  34.29 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  29.38 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  39.77 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  27.53 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  35.62 
 
 		 401 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>