More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1472 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  592  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  42.8 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  38.89 
 
 		 304 aa  188  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  32.89 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  33.18 
 
 		 289 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  32.76 
 
 		 288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  34.5 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  35.08 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  31.27 
 
 		 303 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  30.64 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  32.74 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  32.73 
 
 		 291 aa  105  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 291 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  32.54 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  34.54 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  36.28 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  33.18 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  30.52 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  38.12 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  28.89 
 
 		 309 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 322 aa  97.4  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  30.37 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 304 aa  95.5  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  40.5 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  39.57 
 
 		 331 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 319 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  29.78 
 
 		 310 aa  92.4  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 361 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 318 aa  92  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 154 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 278 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  34.46 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 281 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  44.14 
 
 		 308 aa  89.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 281 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 277 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 301 aa  89.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3232  transcriptional regulator, AraC family  29.56 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0599312  hitchhiker  0.0000105754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 311 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  35.62 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  26.91 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  26.91 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 274 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  28.92 
 
 		 293 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  26.91 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 287 aa  86.3  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  30.09 
 
 		 301 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 284 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  44.44 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  43.3 
 
 		 129 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  40.87 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  37.25 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0193  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  29.26 
 
 		 316 aa  82.8  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  28.82 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 305 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>