More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_47190 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  59.69 
 
 		 774 aa  928    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  59.69 
 
 		 774 aa  927    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  100 
 
 		 784 aa  1590    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  68.91 
 
 		 774 aa  1075    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  59.69 
 
 		 774 aa  928    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  66.88 
 
 		 782 aa  1076    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  67.39 
 
 		 782 aa  1083    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  59.82 
 
 		 774 aa  929    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  67.55 
 
 		 784 aa  1013    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  65.61 
 
 		 777 aa  1055    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  67.13 
 
 		 774 aa  1074    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  59.69 
 
 		 774 aa  926    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  66.71 
 
 		 784 aa  1018    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  50.22 
 
 		 687 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  42.67 
 
 		 809 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  42.54 
 
 		 809 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  42.54 
 
 		 809 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  42.97 
 
 		 807 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  42.68 
 
 		 809 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  45.01 
 
 		 717 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  44.02 
 
 		 731 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  44.68 
 
 		 721 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  44.29 
 
 		 721 aa  535  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  42.39 
 
 		 723 aa  508  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  42.84 
 
 		 720 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  39.86 
 
 		 708 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  42.1 
 
 		 693 aa  481  1e-134  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  31.53 
 
 		 712 aa  312  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  31.44 
 
 		 675 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  31.31 
 
 		 696 aa  297  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  31.22 
 
 		 704 aa  294  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  29.74 
 
 		 731 aa  281  3e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  31 
 
 		 703 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 688 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.06 
 
 		 713 aa  269  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  30.22 
 
 		 690 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  28.91 
 
 		 710 aa  261  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 711 aa  247  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 782 aa  158  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 700 aa  156  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3109  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 738 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0242785  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  24.38 
 
 		 705 aa  139  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 820 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  33.21 
 
 		 833 aa  126  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 709 aa  124  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  23.29 
 
 		 779 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 727 aa  114  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2065  TonB-dependent siderophore receptor  22.77 
 
 		 809 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 727 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  27.25 
 
 		 518 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3787  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 751 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000153626  decreased coverage  0.00000099878 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 821 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  23.27 
 
 		 799 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 813 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  23.16 
 
 		 810 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  25.37 
 
 		 791 aa  107  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  23.23 
 
 		 810 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 799 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0713  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 729 aa  104  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000508975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  22.8 
 
 		 810 aa  105  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  22.56 
 
 		 810 aa  104  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  30.31 
 
 		 797 aa  104  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1760  TonB-dependent heme receptor  23.11 
 
 		 664 aa  103  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0693  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 814 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3888  TonB-dependent receptor  21.31 
 
 		 730 aa  102  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000154411  decreased coverage  0.00438264 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 773 aa  101  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 829 aa  101  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 656 aa  100  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4761  TonB-dependent siderophore receptor  30.34 
 
 		 797 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  24.88 
 
 		 831 aa  99.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 799 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  25.14 
 
 		 791 aa  99.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  25.66 
 
 		 728 aa  99  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 799 aa  98.2  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  22.65 
 
 		 807 aa  97.8  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0582  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 664 aa  97.8  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000848459  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0590  putative TonB-dependent receptor protein  24.41 
 
 		 737 aa  96.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000188689  decreased coverage  0.000190482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 700 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 821 aa  95.9  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 705 aa  94.4  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  30.98 
 
 		 802 aa  94.4  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1585  TonB-dependent siderophore receptor  28.62 
 
 		 828 aa  94  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.927871  normal  0.219293 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 700 aa  93.6  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 700 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 700 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3478  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 825 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  28.03 
 
 		 812 aa  92  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  28.91 
 
 		 713 aa  92  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 700 aa  92  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  28.91 
 
 		 713 aa  92  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2193  TonB-dependent siderophore receptor  23.85 
 
 		 817 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.819603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  28.26 
 
 		 797 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 700 aa  91.3  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  25.08 
 
 		 706 aa  91.3  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4072  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 817 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  20.03 
 
 		 736 aa  90.9  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3544  TonB-dependent siderophore receptor  23.54 
 
 		 808 aa  90.9  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  25.38 
 
 		 700 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.92 
 
 		 706 aa  90.5  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4624  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 797 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185618  decreased coverage  0.0000000123032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>