More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0553 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  100 
 
 		 181 aa  373  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  70.72 
 
 		 181 aa  271  5.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  60 
 
 		 184 aa  235  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  56.07 
 
 		 187 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  56.07 
 
 		 187 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  56.32 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  54.55 
 
 		 199 aa  195  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  51.37 
 
 		 184 aa  191  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  50.57 
 
 		 191 aa  180  8.000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3524  Shikimate kinase  52.12 
 
 		 169 aa  180  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.835023 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02051  shikimate kinase  50 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  47.53 
 
 		 277 aa  156  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01231  shikimate kinase  46.34 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.428162 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  41.86 
 
 		 198 aa  150  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  41.28 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01241  shikimate kinase  44.05 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  43.45 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0111  shikimate kinase  42.94 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  43.93 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  39.88 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_10503  predicted protein  43.37 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  41.28 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  42.11 
 
 		 193 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  41.86 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  37.93 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  39.88 
 
 		 185 aa  127  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  40.12 
 
 		 195 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  40.85 
 
 		 169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  37.21 
 
 		 186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1591  Shikimate kinase  42.07 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  40.99 
 
 		 229 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1589  Shikimate kinase, 3-dehydroquinate synthase  40.24 
 
 		 579 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.025257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1923  Shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.63 
 
 		 579 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0886542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1641  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  39.63 
 
 		 604 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  40.48 
 
 		 170 aa  125  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  45.39 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4543  shikimate kinase  41.82 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.715983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  39.53 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  45.39 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  41.72 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  44.68 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  39.77 
 
 		 182 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  40.83 
 
 		 173 aa  123  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  44.68 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  40.99 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  44.68 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  44.68 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  44.68 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  44.68 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3740  shikimate kinase  43.36 
 
 		 188 aa  121  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  41.52 
 
 		 172 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  41.52 
 
 		 172 aa  121  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  44.29 
 
 		 183 aa  121  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  41.61 
 
 		 173 aa  120  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0392  shikimate kinase  44.29 
 
 		 184 aa  120  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0400  shikimate kinase  36.59 
 
 		 180 aa  120  9e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  45 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  35.06 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  37.8 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  39.18 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  39.18 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  40.37 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  41.57 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  39.04 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0387  shikimate kinase  42.68 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.458969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  42.14 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  44.29 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  40.94 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3489  shikimate kinase  43.26 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4010  shikimate kinase I  45.77 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1132  shikimate kinase  35.63 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  43.67 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  45.71 
 
 		 183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3596  shikimate kinase  34.48 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  39.02 
 
 		 169 aa  117  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  43.97 
 
 		 172 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2486  shikimate kinase  37.2 
 
 		 190 aa  117  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0460027  normal  0.0259491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2170  shikimate kinase  36.59 
 
 		 201 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal  0.0949629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2486  Shikimate kinase  40.48 
 
 		 192 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  42.48 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0375  shikimate kinase I  39.51 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00773873  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  37.58 
 
 		 174 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3598  shikimate kinase  41.43 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000887516  hitchhiker  0.0000000252706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0666  shikimate kinase I  39.63 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000317623  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3064  shikimate kinase  36.84 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  37.2 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  40.62 
 
 		 593 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  39.63 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  37.65 
 
 		 190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3108  shikimate kinase  41.13 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0973333 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  42.18 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  42.07 
 
 		 190 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0261  shikimate kinase I  38.89 
 
 		 171 aa  115  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000154257  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1431  shikimate kinase  37.21 
 
 		 196 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373345  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3368  shikimate kinase I  38.27 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000011554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  40 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3706  shikimate kinase I  38.89 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000103243  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  42.76 
 
 		 189 aa  114  8.999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0038  shikimate kinase  33.94 
 
 		 181 aa  114  8.999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  34.71 
 
 		 197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>