More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2484 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 67 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  45.16 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  45.16 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  45.16 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  45.16 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  45.16 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  45.16 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  45.16 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  43.55 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 432 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 252 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 176 aa  52  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  45.76 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  48.28 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  43.1 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.87 
 
 		 401 aa  50.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4657  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  44.23 
 
 		 305 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.848783 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 77 aa  50.4  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 178 aa  50.4  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0877  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  44.23 
 
 		 317 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 180 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6641  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  40 
 
 		 342 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3860  XRE family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0098  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  44.23 
 
 		 305 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4441  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  38.71 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 255 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0422  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5273  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  44.23 
 
 		 305 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4136  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.527123  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 70 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 181 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 		 105 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0802  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.237035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 199 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  37.1 
 
 		 255 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0163  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.953205  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  37.5 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  37.5 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  37.5 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0023  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.181624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 265 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  36.67 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  38.33 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1325  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1231  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0450833  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  39.66 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  39.66 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 117 aa  47.4  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  40.68 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3869  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 125 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0766  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1297  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 182 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.814605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 218 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 256 aa  47  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0746  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  42.31 
 
 		 306 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0703  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000971993  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 201 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  40.68 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  37.29 
 
 		 196 aa  47  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3248  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2087  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 195 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2601  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 203 aa  46.6  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.512754  hitchhiker  0.000000366247 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03313  transcriptional regulator, Cro/CI family protein  40.32 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1008  DNA-binding protein  40 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>