More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1096 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.9 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 335 aa  58.2  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  52.17 
 
 		 390 aa  58.2  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.26 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  28.3 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.28 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  41.27 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.28 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.28 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.28 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.28 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.28 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.68 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  54 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 412 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 412 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 245 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.98 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.98 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 388 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 225 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 412 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.98 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  54 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 400 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7041  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.971453 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  47.06 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.06 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.06 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  47.06 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.06 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.06 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 363 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 410 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.06 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.06 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 408 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 231 aa  51.6  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.67 
 
 		 227 aa  51.6  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 238 aa  51.6  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  50 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 271 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 221 aa  51.2  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4342  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 186 aa  51.2  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4287  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3966  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 277 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0106  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156451  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 394 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 470 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>