More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3179 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  47.44 
 
 		 1077 aa  682    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  51.76 
 
 		 1584 aa  1314    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  37.21 
 
 		 1537 aa  709    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  100 
 
 		 1593 aa  3050    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  58.29 
 
 		 3408 aa  922    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  45 
 
 		 1955 aa  1009    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  50.11 
 
 		 3930 aa  799    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  55.38 
 
 		 3494 aa  847    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  49.89 
 
 		 2374 aa  694    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  53.86 
 
 		 4151 aa  850    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  47.15 
 
 		 2719 aa  773    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  44.49 
 
 		 2066 aa  660    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  42.68 
 
 		 2024 aa  882    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  50.06 
 
 		 4840 aa  703    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  54.79 
 
 		 7210 aa  868    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  49.59 
 
 		 1071 aa  716    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  45.18 
 
 		 1548 aa  1038    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 2551 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  53.21 
 
 		 2090 aa  801    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  51.24 
 
 		 1305 aa  798    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.96 
 
 		 1587 aa  637    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  51.44 
 
 		 4111 aa  817    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  47.08 
 
 		 1573 aa  672    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.41 
 
 		 3874 aa  841    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  51.24 
 
 		 4080 aa  754    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.71 
 
 		 2762 aa  664    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.37 
 
 		 1816 aa  748    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  37.93 
 
 		 3427 aa  680    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  51.71 
 
 		 5154 aa  1241    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  52.29 
 
 		 2846 aa  764    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  48.34 
 
 		 2060 aa  638    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  53.7 
 
 		 1924 aa  792    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  43.74 
 
 		 2081 aa  998    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  52.73 
 
 		 4607 aa  766    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.97 
 
 		 3092 aa  1204    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  53.99 
 
 		 4930 aa  802    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  56.27 
 
 		 2966 aa  875    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  49.13 
 
 		 3254 aa  976    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  61.77 
 
 		 3355 aa  954    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  38.76 
 
 		 3693 aa  808    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  50.87 
 
 		 3463 aa  750    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  35.99 
 
 		 1520 aa  704    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  48.38 
 
 		 1101 aa  738    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  49.95 
 
 		 1867 aa  803    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  54.73 
 
 		 2126 aa  885    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.07 
 
 		 5400 aa  773    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  51.36 
 
 		 2107 aa  748    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  51.07 
 
 		 1820 aa  808    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  44.99 
 
 		 3281 aa  999    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  56.06 
 
 		 3670 aa  872    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.89 
 
 		 1126 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  52.62 
 
 		 3508 aa  815    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  48.26 
 
 		 3158 aa  1087    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  59.87 
 
 		 5255 aa  877    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  49.07 
 
 		 2367 aa  687    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  54.22 
 
 		 3148 aa  713    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  48.57 
 
 		 7279 aa  1081    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  38.76 
 
 		 3693 aa  808    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  48.94 
 
 		 2376 aa  673    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  35.99 
 
 		 1520 aa  704    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  51.97 
 
 		 2020 aa  744    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  46.54 
 
 		 3449 aa  1127    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  42.64 
 
 		 2232 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  42.65 
 
 		 2230 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.59 
 
 		 3676 aa  761    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  32.5 
 
 		 1559 aa  768    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.39 
 
 		 3696 aa  787    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  44.81 
 
 		 4183 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  47.65 
 
 		 4882 aa  689    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  37.22 
 
 		 1581 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.89 
 
 		 1837 aa  701    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  56.49 
 
 		 1831 aa  869    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  49.7 
 
 		 3493 aa  1172    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.06 
 
 		 2880 aa  778    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  50.6 
 
 		 1602 aa  771    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  50.85 
 
 		 1601 aa  1294    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.17 
 
 		 7110 aa  903    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  52.83 
 
 		 6768 aa  1256    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  46.82 
 
 		 2847 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  38.63 
 
 		 3702 aa  806    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  47 
 
 		 3033 aa  1069    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  53.86 
 
 		 2277 aa  835    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  50.37 
 
 		 2113 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  55.29 
 
 		 1143 aa  830    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  54.07 
 
 		 2108 aa  880    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  49.35 
 
 		 4264 aa  706    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  39 
 
 		 3679 aa  778    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  55.79 
 
 		 1789 aa  879    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  51.17 
 
 		 3711 aa  767    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.51 
 
 		 2078 aa  672    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  49.54 
 
 		 1114 aa  833    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  39.79 
 
 		 1822 aa  724    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  36.26 
 
 		 1577 aa  647    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  69.17 
 
 		 4575 aa  1020    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.83 
 
 		 2136 aa  634  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  44.86 
 
 		 1812 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  43.05 
 
 		 4478 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.07 
 
 		 1656 aa  625  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  44.9 
 
 		 2890 aa  620  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  38.44 
 
 		 1354 aa  617  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>