More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1494 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  53.06 
 
 
250 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  47.77 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  45.08 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  45.08 
 
 
244 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  47.95 
 
 
249 aa  231  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  46.31 
 
 
245 aa  228  7e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  46.56 
 
 
247 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  45.93 
 
 
250 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  43.03 
 
 
244 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  50.21 
 
 
246 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  45.34 
 
 
250 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  45.7 
 
 
271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3382  tRNA pseudouridine synthase A  45.08 
 
 
244 aa  214  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000753277  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  44.4 
 
 
256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  43.85 
 
 
244 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  41.8 
 
 
244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  44.67 
 
 
244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 
248 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  39.92 
 
 
248 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  45.38 
 
 
264 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  45.31 
 
 
252 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  45.9 
 
 
252 aa  201  9e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  42.45 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  43.44 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  44 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  44.53 
 
 
258 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  42.62 
 
 
246 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  42.62 
 
 
246 aa  196  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0346  tRNA pseudouridine synthase A  41.63 
 
 
262 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000224311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  44.26 
 
 
262 aa  195  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  47.93 
 
 
264 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  42.15 
 
 
247 aa  192  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  47.93 
 
 
245 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  41.32 
 
 
252 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  42.56 
 
 
252 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  47.54 
 
 
245 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  41.87 
 
 
248 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  42.56 
 
 
247 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  42.56 
 
 
247 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  42.56 
 
 
247 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  42.56 
 
 
247 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  42.15 
 
 
252 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  42.15 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  42.15 
 
 
247 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  41.32 
 
 
252 aa  188  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  42.52 
 
 
264 aa  187  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0100  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1856  tRNA pseudouridine synthase A  40.98 
 
 
271 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0227794  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0527  tRNA pseudouridine synthase A  40.98 
 
 
271 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1723  tRNA pseudouridine synthase A  40.98 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0771  tRNA pseudouridine synthase A  40.98 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2447  tRNA pseudouridine synthase A  40.98 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.808323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1647  tRNA pseudouridine synthase A  40.98 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2309  tRNA pseudouridine synthase A  40.98 
 
 
270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0622933  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0504  tRNA pseudouridine synthase A  44.31 
 
 
248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00170943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  35.92 
 
 
260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2995  tRNA pseudouridine synthase ACD  43.37 
 
 
278 aa  182  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  35.51 
 
 
245 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1018  pseudouridylate synthase  42.56 
 
 
259 aa  181  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1150  tRNA pseudouridine synthase A  42.68 
 
 
251 aa  181  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00189497  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1931  tRNA pseudouridine synthase A  38.02 
 
 
302 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797555  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0841  tRNA pseudouridine synthase A  40.91 
 
 
305 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258098  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  40.74 
 
 
263 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_446  pseudouridylate synthase  44.26 
 
 
246 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000332106  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0223  tRNA pseudouridine synthase A  40.89 
 
 
293 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00472694  normal  0.027676 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0937  tRNA pseudouridine synthase ACD  42.34 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0226  tRNA pseudouridine synthase A  40.89 
 
 
293 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0481  tRNA pseudouridine synthase A  43.85 
 
 
246 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000089193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1156  tRNA pseudouridine synthase ACD  40.77 
 
 
270 aa  178  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133341  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0165  tRNA pseudouridine synthase A  40.89 
 
 
248 aa  178  8e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1251  tRNA pseudouridine synthase A  43.5 
 
 
259 aa  178  9e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124214  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  38.52 
 
 
262 aa  177  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  35.51 
 
 
245 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002874  tRNA pseudouridine synthase A  37.94 
 
 
264 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.28642  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0677  tRNA pseudouridine synthase A  40.57 
 
 
270 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.873291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  35.83 
 
 
245 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0126  tRNA pseudouridine synthase A  36.33 
 
 
264 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000150331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  35.51 
 
 
245 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  35.51 
 
 
245 aa  176  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0879  tRNA pseudouridine synthase A  38.71 
 
 
248 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2717  tRNA pseudouridine synthase A  42.28 
 
 
287 aa  176  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0374382 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  39.67 
 
 
261 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  35.83 
 
 
245 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  39.67 
 
 
261 aa  176  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  35.51 
 
 
245 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1237  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.93 
 
 
245 aa  176  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2487  tRNA pseudouridine synthase A  43.5 
 
 
252 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0228  tRNA pseudouridine synthase A  40.24 
 
 
253 aa  176  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000401865  normal  0.634585 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03101  tRNA pseudouridine synthase A  38.46 
 
 
264 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3997  tRNA pseudouridine synthase ACD  40.64 
 
 
270 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.541279  hitchhiker  0.00061511 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3803  tRNA pseudouridine synthase A  37.04 
 
 
259 aa  175  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  35.51 
 
 
245 aa  174  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1218  tRNA pseudouridine synthase ACD  38.52 
 
 
245 aa  174  9e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567145  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0520  tRNA pseudouridine synthase A  37.55 
 
 
264 aa  174  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  34.69 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  35.42 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  40.49 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2224  tRNA pseudouridine synthase A  42.8 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0737509  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2019  tRNA pseudouridine synthase A  41.47 
 
 
285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0292827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>