More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2104 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00413  multidrug efflux system protein  39.86 
 
 
1049 aa  743    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02361  aminoglycoside/multidrug efflux system  38.03 
 
 
1037 aa  756    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  38.03 
 
 
1037 aa  756    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3148  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.86 
 
 
1049 aa  743    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1385  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.96 
 
 
1050 aa  776    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.252885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3426  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  49.9 
 
 
1059 aa  1012    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96069  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3456  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.23 
 
 
1042 aa  756    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.417579 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1360  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.47 
 
 
1054 aa  871    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1597  multidrug efflux transporter MexF  51.95 
 
 
1055 aa  1051    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586106  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0010  putative acriflavin resistance transmembrane protein  40.52 
 
 
1049 aa  770    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.461171  normal  0.0539399 
 
 
-
 
NC_003296  RS01889  drug efflux transmembrane protein  39.23 
 
 
1053 aa  755    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43508  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1113  transmembrane multidrug-efflux system lipoprotein transmembrane  49.81 
 
 
1069 aa  964    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.674026  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1355  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  41.86 
 
 
1052 aa  821    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1537  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  41.12 
 
 
1037 aa  815    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209864  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0415  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  39.75 
 
 
1040 aa  804    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0292  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  42.82 
 
 
1051 aa  858    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0334  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  42.08 
 
 
1074 aa  821    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3492  RND multidrug efflux transporter MexF  48.33 
 
 
1047 aa  967    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4692  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.26 
 
 
1044 aa  761    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3100  multidrug efflux RND transporter MexF  50.05 
 
 
1063 aa  1022    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0635013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4304  AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.34 
 
 
1044 aa  766    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1465  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  48.71 
 
 
1061 aa  996    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372368  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2130  hypothetical protein  99.05 
 
 
1050 aa  2114    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2580  hypothetical protein  42.11 
 
 
1050 aa  821    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2104  hypothetical protein  100 
 
 
1052 aa  2133    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2434  hypothetical protein  42.01 
 
 
1050 aa  818    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2282  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.07 
 
 
1047 aa  751    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0161777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2968  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.48 
 
 
1063 aa  1022    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.599397  normal  0.253976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4008  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.13 
 
 
1044 aa  766    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507214  normal  0.0226563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.12 
 
 
1040 aa  833    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297975  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3828  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  48.34 
 
 
1062 aa  932    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130415  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3062  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.99 
 
 
1057 aa  857    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3441  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.01 
 
 
1051 aa  754    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.388058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4334  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50 
 
 
1063 aa  991    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.637408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.53 
 
 
1057 aa  868    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1841  multidrug-efflux transporter protein  48.71 
 
 
1061 aa  996    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1130  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.67 
 
 
1059 aa  794    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1827  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  52.8 
 
 
1071 aa  1068    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0746968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1279  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.81 
 
 
1054 aa  766    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0197931  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2658  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.63 
 
 
1063 aa  1023    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350472  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2894  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.25 
 
 
1032 aa  760    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0114017  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1100  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  66.7 
 
 
1060 aa  1412    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3095  cation/multidrug efflux pump  47.55 
 
 
1042 aa  954    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00680948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0296  hydrophobe/amphiphile efflux pump, HAE1  48.95 
 
 
1066 aa  996    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243004  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1005  hydrophobe/amphiphile efflux pump protein  44.77 
 
 
1057 aa  875    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378843  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1664  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.38 
 
 
1044 aa  845    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186908  normal  0.57083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0401  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.11 
 
 
1055 aa  743    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.913827  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0536  resistance-nodulation-cell division family transporter  41.95 
 
 
1034 aa  844    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0043  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.63 
 
 
1042 aa  889    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0688  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.95 
 
 
1057 aa  865    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0691  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.98 
 
 
1038 aa  803    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.553697  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0886  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.66 
 
 
1052 aa  999    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2105  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  48.8 
 
 
1061 aa  1001    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.179451  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2567  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.97 
 
 
1047 aa  807    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.461697 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3303  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.24 
 
 
1078 aa  989    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.110746  normal  0.948069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1903  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.33 
 
 
1066 aa  973    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819338  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2729  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.41 
 
 
1036 aa  745    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0409192  normal  0.0822346 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.76 
 
 
1047 aa  872    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.518068  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1592  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.42 
 
 
1037 aa  817    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0951856  unclonable  0.000000469931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1793  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.38 
 
 
1062 aa  972    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3428  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.61 
 
 
1065 aa  944    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0709  RND efflux hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  39.71 
 
 
1069 aa  750    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125833  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2892  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  48.24 
 
 
1088 aa  973    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0850  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  49.14 
 
 
1061 aa  969    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.033039  decreased coverage  0.00102824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1230  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  40.75 
 
 
1076 aa  803    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3080  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.86 
 
 
1078 aa  989    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2310  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  48.28 
 
 
1062 aa  995    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107479  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3330  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.02 
 
 
1042 aa  744    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66718  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0949  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40 
 
 
1066 aa  811    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3239  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.94 
 
 
1067 aa  938    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0712  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  55.38 
 
 
1057 aa  1156    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1702  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.17 
 
 
1063 aa  866    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.710777  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3589  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.18 
 
 
1050 aa  776    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421189  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3924  multidrug efflux system protein  39.31 
 
 
1048 aa  745    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0170856  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4866  acriflavin resistance protein F  49.81 
 
 
1081 aa  976    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0385197  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1068  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.11 
 
 
1059 aa  830    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.186507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2817  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.88 
 
 
1043 aa  801    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4071  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.54 
 
 
1055 aa  775    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  0.202748 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1449  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.6 
 
 
1054 aa  759    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.819785  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3015  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  49.14 
 
 
1061 aa  998    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841089  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5709  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.95 
 
 
1063 aa  1070    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0738  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  62.13 
 
 
1055 aa  1303    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4125  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.81 
 
 
1058 aa  993    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0790876  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0941  acriflavin resistance protein D  40.55 
 
 
1056 aa  766    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389771  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1074  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.28 
 
 
1049 aa  965    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1940  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.44 
 
 
1055 aa  758    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0454025  hitchhiker  0.00180133 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3836  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.95 
 
 
1044 aa  754    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1146  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.47 
 
 
1049 aa  967    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.204778  normal  0.908583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2036  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.72 
 
 
1055 aa  754    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.449144  normal  0.194235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.95 
 
 
1044 aa  754    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1408  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.59 
 
 
1058 aa  780    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.902436  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3986  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.9 
 
 
1053 aa  952    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.943465  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4698  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  48.95 
 
 
1071 aa  993    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.294616  normal  0.444302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05540  RND multidrug efflux transporter MexB  40.17 
 
 
1046 aa  772    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.277681  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18780  putative RND efflux transporter  48.15 
 
 
1053 aa  936    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0445074  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32390  RND multidrug efflux transporter MexF  50.61 
 
 
1062 aa  1025    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119837  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38410  multidrug efflux protein  38.55 
 
 
1045 aa  760    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0368685 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4745  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  45.16 
 
 
1057 aa  884    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242644  normal  0.0121523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5351  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  49.14 
 
 
1061 aa  998    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31153  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6073  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  50.95 
 
 
1063 aa  1070    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>