More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1793 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02361  aminoglycoside/multidrug efflux system  41.99 
 
 
1037 aa  833    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03124  multidrug efflux system protein  41.47 
 
 
1034 aa  786    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0440  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.37 
 
 
1034 aa  785    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.99 
 
 
1037 aa  833    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1385  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.87 
 
 
1050 aa  806    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.252885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3426  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  66.41 
 
 
1059 aa  1340    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96069  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1360  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.41 
 
 
1054 aa  892    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1597  multidrug efflux transporter MexF  59.03 
 
 
1055 aa  1171    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586106  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0010  putative acriflavin resistance transmembrane protein  41.9 
 
 
1049 aa  790    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.461171  normal  0.0539399 
 
 
-
 
NC_003296  RS01889  drug efflux transmembrane protein  43.44 
 
 
1053 aa  816    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43508  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1113  transmembrane multidrug-efflux system lipoprotein transmembrane  77.1 
 
 
1069 aa  1519    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.674026  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1355  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  42.3 
 
 
1052 aa  828    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1537  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  42.99 
 
 
1037 aa  846    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209864  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0292  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  45.63 
 
 
1051 aa  879    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0334  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  42.68 
 
 
1074 aa  794    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3492  RND multidrug efflux transporter MexF  63.63 
 
 
1047 aa  1253    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4692  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.94 
 
 
1044 aa  806    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3100  multidrug efflux RND transporter MexF  64.72 
 
 
1063 aa  1328    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0635013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4304  AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.98 
 
 
1044 aa  817    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0316  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  42.97 
 
 
1066 aa  794    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.611401  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1465  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  79.71 
 
 
1061 aa  1657    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372368  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2130  hypothetical protein  49.14 
 
 
1050 aa  1036    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2580  hypothetical protein  43.56 
 
 
1050 aa  838    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2104  hypothetical protein  49.38 
 
 
1052 aa  1031    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2434  hypothetical protein  43.56 
 
 
1050 aa  837    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2865  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.09 
 
 
1048 aa  793    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.536014  normal  0.108337 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2968  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  64.82 
 
 
1063 aa  1335    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.599397  normal  0.253976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4008  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.79 
 
 
1044 aa  812    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507214  normal  0.0226563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.77 
 
 
1040 aa  864    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297975  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3828  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  83.22 
 
 
1062 aa  1644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130415  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3062  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.76 
 
 
1057 aa  861    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4334  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  77.5 
 
 
1063 aa  1513    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.637408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.24 
 
 
1057 aa  854    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1019  inner membrane protein  43.06 
 
 
1066 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1841  multidrug-efflux transporter protein  79.71 
 
 
1061 aa  1657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1130  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.89 
 
 
1059 aa  805    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1827  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  54.92 
 
 
1071 aa  1078    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0746968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1279  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.8 
 
 
1054 aa  801    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0197931  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2658  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  64.35 
 
 
1063 aa  1329    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350472  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2894  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.58 
 
 
1032 aa  792    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0114017  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1100  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  51.51 
 
 
1060 aa  1034    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3095  cation/multidrug efflux pump  45.43 
 
 
1042 aa  911    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00680948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5939  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  42.19 
 
 
1066 aa  792    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794955  normal  0.377291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0296  hydrophobe/amphiphile efflux pump, HAE1  80.48 
 
 
1066 aa  1672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243004  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1005  hydrophobe/amphiphile efflux pump protein  60.12 
 
 
1057 aa  1149    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0378843  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1664  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.34 
 
 
1044 aa  851    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186908  normal  0.57083 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0536  resistance-nodulation-cell division family transporter  42.67 
 
 
1034 aa  850    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0043  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  58.69 
 
 
1042 aa  1138    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0688  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.02 
 
 
1057 aa  895    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0691  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.06 
 
 
1038 aa  798    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.553697  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0886  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  69.29 
 
 
1052 aa  1416    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2105  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  80 
 
 
1061 aa  1660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.179451  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0681  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  43.15 
 
 
1066 aa  800    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2567  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.92 
 
 
1047 aa  791    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.461697 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3303  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  71.6 
 
 
1078 aa  1468    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.110746  normal  0.948069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1190  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.54 
 
 
1057 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0696515  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1903  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  71.65 
 
 
1066 aa  1443    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.819338  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.21 
 
 
1047 aa  855    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.518068  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1592  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.64 
 
 
1037 aa  852    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0951856  unclonable  0.000000469931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1793  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  100 
 
 
1062 aa  2132    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2036  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.23 
 
 
1059 aa  788    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.602316  hitchhiker  0.00575958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3428  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  72.14 
 
 
1065 aa  1434    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0709  RND efflux hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  42.63 
 
 
1069 aa  824    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125833  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2892  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  75.83 
 
 
1088 aa  1536    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0850  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  80.93 
 
 
1061 aa  1639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.033039  decreased coverage  0.00102824 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1230  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  44.9 
 
 
1076 aa  855    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3080  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  63.15 
 
 
1078 aa  1268    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2310  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  60.38 
 
 
1062 aa  1239    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107479  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3239  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  60 
 
 
1067 aa  1158    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0712  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  51.7 
 
 
1057 aa  1030    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1702  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.52 
 
 
1063 aa  887    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.710777  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3589  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.16 
 
 
1050 aa  788    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421189  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4866  acriflavin resistance protein F  77.21 
 
 
1081 aa  1513    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0385197  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1068  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.38 
 
 
1059 aa  838    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.186507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2817  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.71 
 
 
1043 aa  843    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4071  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.26 
 
 
1055 aa  811    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  0.202748 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1998  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.53 
 
 
1066 aa  799    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3015  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  80.38 
 
 
1061 aa  1673    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841089  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5709  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  50.29 
 
 
1063 aa  1004    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0738  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  51.39 
 
 
1055 aa  1014    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4125  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  64.24 
 
 
1058 aa  1287    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0790876  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0941  acriflavin resistance protein D  42.63 
 
 
1056 aa  789    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389771  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1074  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  63.38 
 
 
1049 aa  1256    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3836  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.23 
 
 
1044 aa  807    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1146  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  63.53 
 
 
1049 aa  1255    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.204778  normal  0.908583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.23 
 
 
1044 aa  807    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1408  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.68 
 
 
1058 aa  812    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.902436  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3986  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  63.95 
 
 
1053 aa  1246    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.943465  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2655  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.06 
 
 
1066 aa  793    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665349  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4698  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  80.57 
 
 
1071 aa  1680    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.294616  normal  0.444302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05540  RND multidrug efflux transporter MexB  41.99 
 
 
1046 aa  803    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.277681  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18780  putative RND efflux transporter  57.75 
 
 
1053 aa  1145    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0445074  normal  0.109166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32390  RND multidrug efflux transporter MexF  65.21 
 
 
1062 aa  1313    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119837  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38410  multidrug efflux protein  41.94 
 
 
1045 aa  806    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0368685 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2608  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.53 
 
 
1066 aa  799    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4745  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  59.51 
 
 
1057 aa  1149    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242644  normal  0.0121523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5351  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  80.38 
 
 
1061 aa  1673    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31153  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6073  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  50.29 
 
 
1063 aa  1004    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1457  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.55 
 
 
1055 aa  850    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000798188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3922  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.93 
 
 
1052 aa  963    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.222699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>