More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1537 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00413  multidrug efflux system protein  43.5 
 
 		 1049 aa  841    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02361  aminoglycoside/multidrug efflux system  41.04 
 
 		 1037 aa  812    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03124  multidrug efflux system protein  44.94 
 
 		 1034 aa  842    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0440  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.84 
 
 		 1034 aa  841    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.04 
 
 		 1037 aa  812    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3148  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  43.5 
 
 		 1049 aa  841    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1385  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  41.59 
 
 		 1050 aa  826    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.252885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3426  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  44.55 
 
 		 1059 aa  821    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1360  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.73 
 
 		 1054 aa  875    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1597  multidrug efflux transporter MexF  44.47 
 
 		 1055 aa  830    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586106  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0010  putative acriflavin resistance transmembrane protein  43.47 
 
 		 1049 aa  836    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.461171  normal  0.0539399 
 
 
-
 
NC_003296  RS01889  drug efflux transmembrane protein  42.73 
 
 		 1053 aa  810    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1355  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  45.97 
 
 		 1052 aa  922    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1537  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  100 
 
 		 1037 aa  2085    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209864  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0415  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  42.88 
 
 		 1040 aa  874    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0292  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  47.58 
 
 		 1051 aa  960    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0334  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  48.75 
 
 		 1074 aa  942    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3492  RND multidrug efflux transporter MexF  44.66 
 
 		 1047 aa  819    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4692  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.86 
 
 		 1044 aa  835    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3100  multidrug efflux RND transporter MexF  44.74 
 
 		 1063 aa  833    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0635013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4304  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.87 
 
 		 1044 aa  812    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0316  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  42.36 
 
 		 1066 aa  810    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.611401  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1465  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  43.19 
 
 		 1061 aa  823    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372368  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2580  hypothetical protein  44.96 
 
 		 1050 aa  861    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2434  hypothetical protein  44.68 
 
 		 1050 aa  853    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2968  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.7 
 
 		 1063 aa  843    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.599397  normal  0.253976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4008  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.48 
 
 		 1044 aa  813    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507214  normal  0.0226563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  48.5 
 
 		 1040 aa  935    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3062  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.99 
 
 		 1057 aa  878    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3441  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.69 
 
 		 1051 aa  820    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.388058  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4089  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.78 
 
 		 1050 aa  826    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2741  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.9 
 
 		 1053 aa  827    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0254632  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  46.01 
 
 		 1057 aa  943    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1019  inner membrane protein  42.46 
 
 		 1066 aa  814    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1841  multidrug-efflux transporter protein  43.19 
 
 		 1061 aa  823    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1130  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  52.33 
 
 		 1059 aa  1012    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1827  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.67 
 
 		 1071 aa  818    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0746968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1279  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.62 
 
 		 1054 aa  818    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0197931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2658  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.23 
 
 		 1063 aa  828    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2894  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.83 
 
 		 1032 aa  813    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0114017  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3095  cation/multidrug efflux pump  49.47 
 
 		 1042 aa  969    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00680948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5939  hydrophobe/amphiphile efflux-1 pump, HAE1  42.65 
 
 		 1066 aa  814    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.794955  normal  0.377291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0296  hydrophobe/amphiphile efflux pump, HAE1  42.9 
 
 		 1066 aa  816    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0810  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.57 
 
 		 1053 aa  809    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0578255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0401  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  48.16 
 
 		 1055 aa  980    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.913827  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0536  resistance-nodulation-cell division family transporter  44.69 
 
 		 1034 aa  849    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0688  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.54 
 
 		 1057 aa  907    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0691  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  46.48 
 
 		 1038 aa  861    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.553697  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1118  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.73 
 
 		 1052 aa  809    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.558549  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2105  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  43.38 
 
 		 1061 aa  825    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.179451  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0681  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  42.46 
 
 		 1066 aa  811    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.321186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1190  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  46.15 
 
 		 1057 aa  874    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0696515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3585  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.54 
 
 		 1050 aa  897    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  47.14 
 
 		 1047 aa  934    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.518068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1592  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.79 
 
 		 1037 aa  872    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0951856  unclonable  0.000000469931 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0709  RND efflux hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  42.71 
 
 		 1069 aa  839    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1230  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  44.38 
 
 		 1076 aa  880    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3080  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  45.27 
 
 		 1078 aa  828    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3602  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.13 
 
 		 1046 aa  819    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2310  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.6 
 
 		 1062 aa  842    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0949  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.51 
 
 		 1066 aa  823    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0712  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.5 
 
 		 1057 aa  816    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0993  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  46.47 
 
 		 1048 aa  869    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.379885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3538  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.39 
 
 		 1056 aa  817    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1702  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.56 
 
 		 1063 aa  854    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.710777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3589  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.47 
 
 		 1050 aa  837    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3924  multidrug efflux system protein  42.62 
 
 		 1048 aa  835    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0170856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1068  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.08 
 
 		 1059 aa  863    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.186507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2817  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  44.42 
 
 		 1043 aa  851    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4071  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.5 
 
 		 1055 aa  839    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  0.202748 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3420  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.25 
 
 		 1042 aa  840    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1998  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.46 
 
 		 1066 aa  816    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3015  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.9 
 
 		 1061 aa  814    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0738  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.64 
 
 		 1055 aa  817    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4125  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.94 
 
 		 1058 aa  825    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0790876  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0538  AcrB/AcrD family multidrug resistance protein  41.31 
 
 		 1048 aa  816    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199673  normal  0.872862 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0941  acriflavin resistance protein D  43.39 
 
 		 1056 aa  830    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1074  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.75 
 
 		 1049 aa  820    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3836  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.96 
 
 		 1044 aa  842    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1146  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.75 
 
 		 1049 aa  819    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.204778  normal  0.908583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.96 
 
 		 1044 aa  842    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1408  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.74 
 
 		 1058 aa  856    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.902436  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3862  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.8 
 
 		 1051 aa  813    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.395414  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2655  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.46 
 
 		 1066 aa  815    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.665349  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4698  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.99 
 
 		 1071 aa  814    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.294616  normal  0.444302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05540  RND multidrug efflux transporter MexB  43 
 
 		 1046 aa  838    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.277681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32390  RND multidrug efflux transporter MexF  44.85 
 
 		 1062 aa  825    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2608  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.46 
 
 		 1066 aa  816    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728592  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5351  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.9 
 
 		 1061 aa  814    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31153  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1076  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.69 
 
 		 1063 aa  833    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.421657  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1457  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.74 
 
 		 1055 aa  879    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000798188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3922  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  46.44 
 
 		 1052 aa  956    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  42.04 
 
 		 1041 aa  817    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.362215  unclonable  0.00000213823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1078  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  44.75 
 
 		 1049 aa  820    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4045  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.86 
 
 		 1044 aa  840    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0118  transmembrane efflux protein  41.59 
 
 		 1048 aa  823    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0330  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  43.29 
 
 		 1054 aa  833    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0411  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.85 
 
 		 1073 aa  836    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0776  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  41.82 
 
 		 1055 aa  823    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3554  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.61 
 
 		 1046 aa  821    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>