151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3285 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3285  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 438 aa  833    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  39.54 
 
 		 443 aa  233  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  40.5 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6019  precorrin-3B synthase  39.63 
 
 		 452 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0172666  normal  0.33411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  40.4 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  40.25 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  35.57 
 
 		 437 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  33.72 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  33.57 
 
 		 449 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  31.31 
 
 		 424 aa  123  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  31.93 
 
 		 380 aa  117  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  30.92 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  32.68 
 
 		 423 aa  114  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  33.42 
 
 		 381 aa  99  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  31.39 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.92 
 
 		 432 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  29.52 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  30.29 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  29.46 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  25.06 
 
 		 599 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  26.52 
 
 		 586 aa  80.1  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  30.81 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  25.31 
 
 		 596 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  24.63 
 
 		 596 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  29.55 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  30.95 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  24.63 
 
 		 601 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  29.95 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.95 
 
 		 565 aa  76.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  27.03 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  25.06 
 
 		 605 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  27.01 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  25.74 
 
 		 595 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  24.73 
 
 		 608 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  26.78 
 
 		 595 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2150  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  38.95 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0291416  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  29.26 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  24.87 
 
 		 615 aa  71.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.16 
 
 		 562 aa  70.5  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  22.19 
 
 		 513 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  22.19 
 
 		 513 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  28.99 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  25.36 
 
 		 586 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  28.99 
 
 		 516 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  25.86 
 
 		 590 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  23.32 
 
 		 564 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  27.49 
 
 		 732 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  28.1 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  22.95 
 
 		 560 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  28.92 
 
 		 487 aa  66.6  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  27.62 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  23.22 
 
 		 571 aa  66.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  28.26 
 
 		 482 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  21.01 
 
 		 553 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  34.19 
 
 		 469 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  23.16 
 
 		 604 aa  64.3  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  20.52 
 
 		 480 aa  64.3  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  22.53 
 
 		 550 aa  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  20.74 
 
 		 553 aa  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.76 
 
 		 556 aa  63.9  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 510 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.67 
 
 		 568 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  23.13 
 
 		 573 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  30.38 
 
 		 494 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  43.27 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  27.1 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  23.67 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  43.08 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  21.85 
 
 		 592 aa  60.1  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  28.7 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  22.55 
 
 		 567 aa  59.7  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  22.82 
 
 		 581 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  22.59 
 
 		 581 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  22.84 
 
 		 590 aa  58.9  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  28.88 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  23.57 
 
 		 560 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  22.33 
 
 		 521 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  22.33 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  20.88 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  20.92 
 
 		 541 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  24.43 
 
 		 439 aa  57  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  29.82 
 
 		 586 aa  55.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  29.67 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.98 
 
 		 570 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  22.48 
 
 		 567 aa  54.3  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  20.79 
 
 		 510 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  22.5 
 
 		 590 aa  53.5  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  30.97 
 
 		 431 aa  53.5  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  22.04 
 
 		 569 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  29.62 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  22.98 
 
 		 569 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  21.31 
 
 		 621 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.09 
 
 		 556 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  21.84 
 
 		 560 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  21.84 
 
 		 560 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  22.01 
 
 		 570 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  22.36 
 
 		 560 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  26.82 
 
 		 633 aa  51.2  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  20.36 
 
 		 519 aa  50.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  28.4 
 
 		 521 aa  50.4  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>