More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2814 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  59.96 
 
 
560 aa  659    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  57.58 
 
 
573 aa  639    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  63.48 
 
 
560 aa  728    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  59.89 
 
 
560 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  64.36 
 
 
592 aa  711    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  64.55 
 
 
556 aa  711    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  63.9 
 
 
570 aa  700    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  77.17 
 
 
564 aa  900    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  64.05 
 
 
569 aa  715    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  59.62 
 
 
568 aa  689    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  63.62 
 
 
556 aa  728    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  59.89 
 
 
571 aa  676    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  62.61 
 
 
569 aa  706    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  73.88 
 
 
560 aa  858    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  100 
 
 
565 aa  1157    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  70.9 
 
 
550 aa  828    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  59.41 
 
 
590 aa  648    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  60.92 
 
 
567 aa  693    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  60.14 
 
 
560 aa  661    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  58.53 
 
 
581 aa  665    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  59.64 
 
 
560 aa  665    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  64.96 
 
 
569 aa  719    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  73.75 
 
 
562 aa  864    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  57.62 
 
 
581 aa  672    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  62.11 
 
 
586 aa  702    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  60.96 
 
 
573 aa  696    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  66.9 
 
 
569 aa  777    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  60.14 
 
 
560 aa  661    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  56.99 
 
 
563 aa  632  1e-180  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  56.44 
 
 
570 aa  627  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  39.49 
 
 
540 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  40.42 
 
 
567 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  39.26 
 
 
540 aa  364  2e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  39.26 
 
 
540 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  38.89 
 
 
540 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  38.89 
 
 
540 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  39.07 
 
 
540 aa  362  9e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  38.89 
 
 
540 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  38.52 
 
 
540 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  38.93 
 
 
519 aa  361  2e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  38.93 
 
 
540 aa  359  6e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  38.57 
 
 
540 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  38.7 
 
 
540 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  38.19 
 
 
586 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.57 
 
 
591 aa  355  8.999999999999999e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  39.66 
 
 
521 aa  355  1e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  36.18 
 
 
542 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  38.75 
 
 
541 aa  349  7e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  38.92 
 
 
591 aa  343  5.999999999999999e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38.87 
 
 
592 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  38.34 
 
 
589 aa  333  5e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  37.04 
 
 
551 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.28 
 
 
603 aa  318  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  35.12 
 
 
553 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  36.94 
 
 
586 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.45 
 
 
569 aa  302  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.52 
 
 
793 aa  295  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  35.48 
 
 
643 aa  294  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.66 
 
 
805 aa  291  3e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  33.65 
 
 
510 aa  287  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  34.57 
 
 
648 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  34.93 
 
 
513 aa  286  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  34.93 
 
 
513 aa  286  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.02 
 
 
590 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  34.47 
 
 
516 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  34.44 
 
 
639 aa  278  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  34.44 
 
 
536 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  32.78 
 
 
492 aa  274  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  34.03 
 
 
512 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  32.12 
 
 
553 aa  266  7e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  32.64 
 
 
521 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  31.87 
 
 
553 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  33.01 
 
 
513 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  31.4 
 
 
513 aa  257  5e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  30.93 
 
 
542 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  32.1 
 
 
586 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  31.8 
 
 
599 aa  234  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  31.35 
 
 
480 aa  229  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  30.46 
 
 
615 aa  227  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  31.22 
 
 
633 aa  217  5e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  29.67 
 
 
590 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  30.83 
 
 
548 aa  206  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  28.66 
 
 
621 aa  206  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5119  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.08 
 
 
757 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257814  normal  0.684028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  31.61 
 
 
595 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  26.88 
 
 
608 aa  204  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  31.61 
 
 
595 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2147  sulfite reductase (ferredoxin)  28.19 
 
 
552 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0201969  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  29.34 
 
 
605 aa  201  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.48 
 
 
545 aa  200  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  29.51 
 
 
586 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  28.6 
 
 
590 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  29.98 
 
 
604 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3112  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.27 
 
 
552 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  29.03 
 
 
596 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  29.03 
 
 
601 aa  197  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  29.03 
 
 
596 aa  196  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2730  sulphite reductase  28.46 
 
 
552 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759699  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2462  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.25 
 
 
552 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133864  hitchhiker  0.0089814 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1146  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.05 
 
 
697 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>