236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3267 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 423 aa  825    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  44.52 
 
 		 430 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  37.69 
 
 		 424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  36.6 
 
 		 386 aa  177  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  37.91 
 
 		 464 aa  172  9e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  39.56 
 
 		 449 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  36.99 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  36.75 
 
 		 428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  36.14 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  34.06 
 
 		 380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.34 
 
 		 432 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  37 
 
 		 437 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  31.14 
 
 		 431 aa  143  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  25.54 
 
 		 732 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  30.99 
 
 		 409 aa  137  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  30.58 
 
 		 439 aa  136  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  30.94 
 
 		 507 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  28.79 
 
 		 439 aa  133  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  32.35 
 
 		 443 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  31.51 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  34.47 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  31.79 
 
 		 510 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  30.39 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  31.91 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  30.51 
 
 		 599 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  31.86 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  35.66 
 
 		 381 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  31.41 
 
 		 443 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  31.28 
 
 		 438 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  25.18 
 
 		 494 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  32.99 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  30.42 
 
 		 465 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3285  precorrin-3B synthase  34.47 
 
 		 438 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.533055  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  27.95 
 
 		 615 aa  123  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  27.71 
 
 		 608 aa  123  7e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  33.74 
 
 		 456 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.04 
 
 		 562 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  27.31 
 
 		 586 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  34.54 
 
 		 486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  24.19 
 
 		 480 aa  114  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  28.68 
 
 		 571 aa  114  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  31.58 
 
 		 443 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  25.19 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  23.85 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.23 
 
 		 568 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  25.19 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  24.75 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  26.67 
 
 		 605 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.05 
 
 		 581 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.68 
 
 		 550 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  32.69 
 
 		 483 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1626  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  33.44 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.470677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  31.22 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  27.05 
 
 		 581 aa  106  8e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  28.4 
 
 		 595 aa  106  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7174  precorrin-3B synthase  31.94 
 
 		 460 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  26.75 
 
 		 560 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  30.61 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  27.23 
 
 		 595 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  24.34 
 
 		 516 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  26.04 
 
 		 586 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  32.44 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  28.13 
 
 		 590 aa  104  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  27.18 
 
 		 586 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  25.71 
 
 		 604 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  25.13 
 
 		 521 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  30.3 
 
 		 372 aa  104  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6019  precorrin-3B synthase  31.3 
 
 		 452 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0172666  normal  0.33411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  25.24 
 
 		 569 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  28.13 
 
 		 567 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  28.5 
 
 		 560 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  29.95 
 
 		 454 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  25.58 
 
 		 512 aa  99  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  25.81 
 
 		 596 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  26.54 
 
 		 542 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  24.68 
 
 		 560 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  25.69 
 
 		 569 aa  97.1  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  24.88 
 
 		 601 aa  97.1  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  24.51 
 
 		 521 aa  97.1  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  26.28 
 
 		 573 aa  96.7  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.67 
 
 		 567 aa  96.3  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  25.25 
 
 		 596 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  26.42 
 
 		 553 aa  95.5  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2489  precorrin-3B synthase  30.46 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2534  precorrin-3B synthase  30.46 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.35067  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2526  precorrin-3B synthase  30.46 
 
 		 373 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  25.26 
 
 		 564 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  25.8 
 
 		 513 aa  95.5  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.25 
 
 		 569 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.61 
 
 		 570 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1783  hypothetical protein  29.95 
 
 		 345 aa  93.6  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  23.31 
 
 		 592 aa  93.6  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  26.26 
 
 		 590 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  23.23 
 
 		 536 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2894  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  43.24 
 
 		 282 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  30.05 
 
 		 363 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  30.02 
 
 		 463 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  47.62 
 
 		 423 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  25.85 
 
 		 492 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  24.82 
 
 		 551 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>