288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1592 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  94.17 
 
 		 463 aa  735    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  100 
 
 		 454 aa  872    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  83.19 
 
 		 478 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  76.37 
 
 		 483 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  83.37 
 
 		 482 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  81.82 
 
 		 482 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  81.82 
 
 		 516 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2398  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  59.14 
 
 		 479 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.121766  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  49.38 
 
 		 507 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  57.17 
 
 		 482 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  48.86 
 
 		 510 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2113  precorrin-3B synthase  57.61 
 
 		 482 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.46756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1950  precorrin-3B synthase  57.39 
 
 		 482 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0588771  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0896  precorrin-3B synthase  57.39 
 
 		 482 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1161  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  57.39 
 
 		 482 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.326083  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0264  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  57.39 
 
 		 482 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1602  nitrite/sulfite reductase domain-containing protein  57.39 
 
 		 482 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.036421  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  49.77 
 
 		 447 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  49.32 
 
 		 476 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  48.65 
 
 		 465 aa  322  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  46.15 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  46.73 
 
 		 443 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  47.42 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  48.14 
 
 		 456 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  45.39 
 
 		 443 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  44.35 
 
 		 438 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  48.68 
 
 		 486 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  45.37 
 
 		 443 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  39.43 
 
 		 431 aa  238  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  38.51 
 
 		 409 aa  223  7e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  37.31 
 
 		 439 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  29.9 
 
 		 494 aa  189  9e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  29.04 
 
 		 732 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  30.79 
 
 		 586 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  27.13 
 
 		 487 aa  150  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  30.86 
 
 		 590 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  28.78 
 
 		 615 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  29.72 
 
 		 586 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  30.54 
 
 		 604 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  32.35 
 
 		 599 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  30.96 
 
 		 595 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  33.18 
 
 		 424 aa  141  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  29.93 
 
 		 595 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  28.4 
 
 		 596 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  28.75 
 
 		 601 aa  137  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  28.4 
 
 		 596 aa  137  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  28.99 
 
 		 605 aa  136  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  29.26 
 
 		 608 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  29.03 
 
 		 590 aa  133  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  32.24 
 
 		 464 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  26.28 
 
 		 516 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  28.95 
 
 		 439 aa  126  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  31.29 
 
 		 430 aa  123  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  27.18 
 
 		 510 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  28.04 
 
 		 521 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  26.45 
 
 		 513 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  26.45 
 
 		 513 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  26.44 
 
 		 542 aa  113  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  33.58 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1438  precorrin-3B synthase  33.58 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.276589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  30.23 
 
 		 380 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1713  precorrin-3B synthase  34.07 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00909167 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2533  precorrin-3B synthase  30.17 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.134816  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  23.41 
 
 		 540 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  23.41 
 
 		 540 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  23.16 
 
 		 540 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  23.41 
 
 		 540 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  23.16 
 
 		 540 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  23.16 
 
 		 540 aa  107  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  26.16 
 
 		 492 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  23.41 
 
 		 540 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  31.94 
 
 		 408 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  23.1 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  33.06 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  23.1 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  28.28 
 
 		 443 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1435  precorrin-3B synthase  31.28 
 
 		 437 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.592884  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  22.9 
 
 		 540 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  23.35 
 
 		 540 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  29.09 
 
 		 512 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  23.1 
 
 		 541 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  29.77 
 
 		 386 aa  103  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  31.5 
 
 		 378 aa  103  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.78 
 
 		 793 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  25.45 
 
 		 621 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  26.18 
 
 		 536 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  22.65 
 
 		 480 aa  101  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.65 
 
 		 805 aa  99.8  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  23.23 
 
 		 553 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  26.24 
 
 		 551 aa  98.2  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  25.69 
 
 		 513 aa  97.4  4e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3116  precorrin-3B synthase  31.89 
 
 		 449 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  27.86 
 
 		 567 aa  97.4  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  24.75 
 
 		 513 aa  94.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  27.23 
 
 		 571 aa  94  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2051  Sulfite reductase (ferredoxin)  23.73 
 
 		 720 aa  93.2  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.773496 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  22.73 
 
 		 553 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  25 
 
 		 542 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2439  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.91 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341511  normal  0.0829631 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  25.32 
 
 		 633 aa  90.9  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>