182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0151 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0151  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta- component ferrodoxin domain protein  100 
 
 		 408 aa  769    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0318  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  43.86 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2489  precorrin-3B synthase  45.6 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.333591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2534  precorrin-3B synthase  45.6 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.35067  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2526  precorrin-3B synthase  45.6 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12100  cobalamin biosynthesis protein cobG  43.94 
 
 		 363 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00940846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3429  precorrin-3B synthase  42.97 
 
 		 372 aa  213  7e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.506257  normal  0.446466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3106  precorrin-3B synthase  42.93 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17650  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  46.92 
 
 		 292 aa  200  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0220438  normal  0.761775 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2494  nitrite/sulfite reductase hemoprotein subnit beta ferrodoxin domain-containing protein  42.9 
 
 		 367 aa  196  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149164 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0576  precorrin-3B synthase  43.5 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.244524  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5592  Sulfite reductase beta subunit (hemoprotein)- like protein  43.1 
 
 		 473 aa  194  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1519  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  39.61 
 
 		 481 aa  182  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0825166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1626  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  46.39 
 
 		 335 aa  179  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.470677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2481  precorrin-3B synthase  38.3 
 
 		 378 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0547656  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2894  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  43.71 
 
 		 282 aa  170  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.804468  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2192  precorrin-3B synthase  39.74 
 
 		 351 aa  158  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1783  hypothetical protein  35.31 
 
 		 345 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3411  cobalamin biosynthesis protein CobG, precorrin-3B synthase  44.19 
 
 		 207 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3508  precorrin-3B synthase  32.03 
 
 		 430 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541497  normal  0.642272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1899  precorrin-3B synthase  28.68 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0826299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3145  putative precorrin-3B synthase (cobG)  32.36 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4417  ferredoxin--nitrite reductase  31.88 
 
 		 447 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4877  cobalamin biosynthesis protein CobG, putative  33.85 
 
 		 476 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1851  ferredoxin--nitrite reductase  26.1 
 
 		 487 aa  113  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0665038  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_004310  BR1286  nitrite reductase family protein  32.43 
 
 		 431 aa  112  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1568  precorrin-3B synthase  32.83 
 
 		 483 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.279604  normal  0.0675664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0604  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.97 
 
 		 432 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1592  precorrin-3B synthase  30.26 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.994403  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4571  precorrin-3B synthase  31.09 
 
 		 469 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1249  precorrin-3B synthase  32.13 
 
 		 409 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0458561  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0121  precorrin-3B synthase  25.96 
 
 		 494 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5369  precorrin-3B synthase  30.59 
 
 		 507 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062725  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3267  precorrin-3B synthase  31.47 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0180034 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2248  putative oxidoreductase  31.82 
 
 		 456 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3143  precorrin-3B synthase  30.17 
 
 		 465 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4619  precorrin-3B synthase  29.72 
 
 		 443 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.376609 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  25.24 
 
 		 732 aa  93.2  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  28.82 
 
 		 599 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4824  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta subunit  29.44 
 
 		 478 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0801  precorrin-3B synthase  32.9 
 
 		 464 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0557903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  26.24 
 
 		 586 aa  90.9  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1194  precorrin-3B synthase  30.86 
 
 		 482 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0317253  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1674  precorrin-3B synthase  30.86 
 
 		 516 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0242876  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  28 
 
 		 569 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2211  precorrin-3B synthase  29.43 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1574  precorrin-3B synthase  28.94 
 
 		 463 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  28 
 
 		 569 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1647  precorrin-3B synthase  30.73 
 
 		 482 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690908  normal  0.296785 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2930  precorrin-3B synthase  31.02 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.277025  hitchhiker  0.00312448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4707  precorrin-3B synthase  29.41 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879568  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4829  precorrin-3B synthase  29.41 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0669399  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  25.96 
 
 		 521 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  26.93 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4885  precorrin-3B synthase  29.56 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  25.74 
 
 		 590 aa  82.8  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0341  precorrin-3B synthase  30.26 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  26.39 
 
 		 581 aa  80.5  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.19 
 
 		 567 aa  79.7  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  25.43 
 
 		 601 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  25.43 
 
 		 596 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27757  predicted protein  23.47 
 
 		 621 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  26.46 
 
 		 608 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26485  putative oxidoreductase  32.05 
 
 		 486 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00580317  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  25.3 
 
 		 615 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.63 
 
 		 569 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  23.6 
 
 		 536 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  25.18 
 
 		 605 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5851  precorrin-3B synthase  31.59 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  26.2 
 
 		 592 aa  77  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  24.94 
 
 		 596 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  26.87 
 
 		 568 aa  76.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  26.15 
 
 		 492 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  25.77 
 
 		 567 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  27.86 
 
 		 560 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  26.93 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  25 
 
 		 513 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  25.24 
 
 		 595 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  25 
 
 		 513 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  24.56 
 
 		 562 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  25.43 
 
 		 586 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  24.63 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  26.04 
 
 		 595 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.98 
 
 		 805 aa  71.2  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2818  precorrin-3B synthase  29.33 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.68389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  23.53 
 
 		 604 aa  70.1  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.42 
 
 		 581 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  24.56 
 
 		 553 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  24.34 
 
 		 560 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  24.87 
 
 		 590 aa  68.2  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  26.12 
 
 		 573 aa  67.4  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  20.79 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  24.03 
 
 		 510 aa  67  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1245  putative oxidoreductase  38.73 
 
 		 510 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0347263  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  26.02 
 
 		 560 aa  66.6  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  27.81 
 
 		 570 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  25.38 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  24.75 
 
 		 571 aa  63.9  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  25.25 
 
 		 793 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1967  precorrin-3B synthase  43.88 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0190248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>