More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3857 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  79.04 
 
 
590 aa  914    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  92.5 
 
 
560 aa  1066    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  58.7 
 
 
550 aa  642    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  59.4 
 
 
564 aa  642    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  57.9 
 
 
571 aa  647    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  69.22 
 
 
560 aa  800    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  60.88 
 
 
562 aa  680    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  58.65 
 
 
556 aa  644    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  79.89 
 
 
563 aa  930    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  59.89 
 
 
565 aa  660    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  62.13 
 
 
569 aa  707    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  58.93 
 
 
570 aa  638    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  76.44 
 
 
573 aa  910    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  65.45 
 
 
592 aa  714    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  68.13 
 
 
570 aa  750    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  59.57 
 
 
560 aa  661    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  58.57 
 
 
567 aa  639    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  92.14 
 
 
560 aa  1064    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  64.48 
 
 
569 aa  726    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  59.82 
 
 
568 aa  670    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  91.79 
 
 
560 aa  1062    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  58.11 
 
 
581 aa  644    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  57.64 
 
 
581 aa  636    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  65.39 
 
 
569 aa  732    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  60.78 
 
 
573 aa  692    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  92.14 
 
 
560 aa  1064    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  100 
 
 
560 aa  1144    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  62.17 
 
 
556 aa  674    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  56.44 
 
 
586 aa  615  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  56.84 
 
 
569 aa  613  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  39.92 
 
 
521 aa  352  8e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  34.35 
 
 
540 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  35.73 
 
 
540 aa  301  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  35.06 
 
 
567 aa  300  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  35.17 
 
 
540 aa  296  5e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  35.12 
 
 
540 aa  296  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  35.36 
 
 
540 aa  296  7e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  35.36 
 
 
540 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  35.36 
 
 
540 aa  296  8e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  35.36 
 
 
540 aa  296  8e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  35.36 
 
 
540 aa  296  8e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  35.17 
 
 
540 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  35.36 
 
 
540 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  36.24 
 
 
541 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.85 
 
 
589 aa  287  2.9999999999999996e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  33.39 
 
 
542 aa  286  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  35.53 
 
 
551 aa  282  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  33.88 
 
 
553 aa  279  8e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.62 
 
 
591 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  34.24 
 
 
643 aa  272  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  32.65 
 
 
586 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  34.71 
 
 
648 aa  270  7e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.83 
 
 
569 aa  265  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  35.28 
 
 
513 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  35.28 
 
 
513 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.88 
 
 
793 aa  259  7e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  32.09 
 
 
519 aa  259  7e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  34.45 
 
 
639 aa  257  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.78 
 
 
603 aa  254  3e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  32.95 
 
 
510 aa  253  7e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  33.39 
 
 
591 aa  253  9.000000000000001e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.19 
 
 
590 aa  250  5e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  32.67 
 
 
516 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.91 
 
 
805 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  32.24 
 
 
536 aa  240  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.12 
 
 
592 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  32.25 
 
 
521 aa  236  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  31.14 
 
 
513 aa  233  8.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  32.54 
 
 
512 aa  229  9e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  31.38 
 
 
586 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  29.81 
 
 
513 aa  227  3e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  30.47 
 
 
492 aa  219  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  30.39 
 
 
586 aa  219  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  31.05 
 
 
615 aa  217  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  29.34 
 
 
553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  29.23 
 
 
553 aa  213  4.9999999999999996e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  30.54 
 
 
480 aa  211  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  29.73 
 
 
542 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  29.57 
 
 
548 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  29.36 
 
 
590 aa  204  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.34 
 
 
545 aa  203  8e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  29.49 
 
 
599 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  28.14 
 
 
633 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2689  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.69 
 
 
553 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.671477  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2229  Sulfite reductase (ferredoxin)  30.89 
 
 
553 aa  194  5e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  28.18 
 
 
608 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.28 
 
 
557 aa  192  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2371  sulphite reductase hemoprotein, beta subunit  29.45 
 
 
550 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2425  sulfite reductase oxidoreductase protein  30.16 
 
 
553 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3324  sulfite reductase (ferredoxin)  29.45 
 
 
550 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1884  sulfite reductase (ferredoxin)  29.65 
 
 
550 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1978  sulfite reductase (ferredoxin)  29.86 
 
 
550 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126005  normal  0.0650245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  29.59 
 
 
557 aa  189  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10550  putative sulfite or nitrite reductas  29.22 
 
 
557 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2147  sulfite reductase (ferredoxin)  28.05 
 
 
552 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0201969  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  29.04 
 
 
586 aa  189  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0770  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like protein  29.25 
 
 
543 aa  187  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259227  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40770  sulfite reductase  28.05 
 
 
552 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74513  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  27.52 
 
 
604 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3457  sulfite reductase  27.85 
 
 
552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.998056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>