More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2355 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2355  Ferredoxin--nitrite reductase  100 
 
 
643 aa  1309    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3793  assimilatory nitrite reductase (ferredoxin) precursor  54.82 
 
 
648 aa  720    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0515701  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2055  ferredoxin--nitrite reductase  61.37 
 
 
639 aa  778    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2373  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  34.97 
 
 
567 aa  337  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0410  Ferredoxin--nitrite reductase  36.11 
 
 
541 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1146  ferredoxin--nitrite reductase  34.95 
 
 
540 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1746  ferredoxin--nitrite reductase  37.22 
 
 
553 aa  318  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1788  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  37.9 
 
 
550 aa  317  6e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0430793  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2244  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35.93 
 
 
562 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0181791 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0435  Ferredoxin--nitrite reductase  35.22 
 
 
586 aa  308  3e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2351  ferredoxin--nitrite reductase  34.7 
 
 
573 aa  307  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0963  ferredoxin--nitrite reductase  36.8 
 
 
551 aa  306  7e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0963842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1585  putative sulfite reductase  34.31 
 
 
540 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0165344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1307  ferredoxin-nitrite reductase  34.5 
 
 
540 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1306  ferredoxin-nitrite reductase  33.89 
 
 
540 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1333  Ferredoxin--nitrite reductase  35.33 
 
 
542 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1515  putative sulfite reductase  34.26 
 
 
540 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000207248 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1333  nitrite reductase  34.26 
 
 
540 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1443  nitrite reductase  34.26 
 
 
540 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1479  putative sulfite reductase  33.92 
 
 
540 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6695  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta- component, ferrodoxin-like protein  34.49 
 
 
560 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1347  ferredoxin--nitrite reductase  33.89 
 
 
540 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3865  putative sulfite reductase  33.72 
 
 
540 aa  301  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861869 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12830  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  35.54 
 
 
560 aa  299  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1547  nitrite reductase  33.72 
 
 
540 aa  299  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6105  sulfite reductase (ferredoxin)  35.1 
 
 
586 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0267627 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1888  putative nitrite/sulphite reductase  37.14 
 
 
564 aa  297  5e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3125  ferredoxin--nitrite reductase  35.66 
 
 
581 aa  297  5e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.375111  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4085  sulfite reductase (ferredoxin)  35.54 
 
 
569 aa  294  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.546103  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2814  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35.48 
 
 
565 aa  294  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1074  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.74 
 
 
556 aa  292  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0746532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7370  Sulfite reductase (ferredoxin)  37.55 
 
 
569 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3704  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  36.16 
 
 
569 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3166  Sulfite reductase (ferredoxin)  33.27 
 
 
590 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09960  sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  35.51 
 
 
571 aa  283  7.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1739  Sulfite reductase (ferredoxin)  36.31 
 
 
556 aa  282  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4381  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  36.11 
 
 
592 aa  282  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1068  ferredoxin-nitrite reductase  34.27 
 
 
510 aa  282  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4573  ferredoxin-nitrite reductase  35.17 
 
 
521 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5167  Sulfite reductase (ferredoxin)  35.34 
 
 
568 aa  280  6e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2820  Sulfite reductase (ferredoxin)  34.8 
 
 
581 aa  280  7e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000237044 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1758  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.03 
 
 
591 aa  280  8e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.673928  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1327  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.11 
 
 
590 aa  279  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.994392  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2771  Sulfite reductase (ferredoxin)  32.65 
 
 
573 aa  279  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1239  Sulfite reductase (ferredoxin)  34.95 
 
 
570 aa  279  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000946493  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12419  ferredoxin-dependent nitrite reductase nirA  34.51 
 
 
563 aa  278  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00392921  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0241  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.69 
 
 
569 aa  277  4e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2333  ferredoxin--nitrite reductase  33.68 
 
 
492 aa  276  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0525  ferredoxin--nitrite reductase  34.5 
 
 
569 aa  276  7e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.873826  normal  0.355394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0662  Sulfite reductase (ferredoxin)  34.38 
 
 
567 aa  276  1.0000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0223437 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2284  ferredoxin-nitrite reductase  33.27 
 
 
513 aa  276  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.16 
 
 
793 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4539  ferredoxin-nitrite reductase  34.06 
 
 
536 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1407  ferredoxin--nitrite reductase  36.57 
 
 
521 aa  275  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.89894  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2656  ferredoxin-nitrite reductase  35.38 
 
 
513 aa  273  6e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0143878  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3857  ferredoxin--nitrite reductase  34.24 
 
 
560 aa  272  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.916931  normal  0.0674078 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3487  ferredoxin--nitrite reductase  34.62 
 
 
560 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0718  Sulfite reductase (ferredoxin)  33.33 
 
 
570 aa  270  5e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1683  ferredoxin-nitrite reductase  34.77 
 
 
516 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.282722 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3537  ferredoxin--nitrite reductase  34.43 
 
 
560 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0760969  normal  0.976843 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3474  ferredoxin--nitrite reductase  34.43 
 
 
560 aa  269  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437391  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0864  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  32.74 
 
 
589 aa  269  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2686  ferredoxin--nitrite reductase  33.84 
 
 
560 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.866892  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1407  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  34.17 
 
 
586 aa  267  5e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3641  ferredoxin-nitrite reductase  33.93 
 
 
513 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0139334  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2468  ferredoxin-nitrite reductase  33.93 
 
 
513 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2855  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.69 
 
 
592 aa  265  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29861  ferredoxin-nitrite reductase  34.4 
 
 
542 aa  264  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35.43 
 
 
805 aa  263  8.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21711  ferredoxin-nitrite reductase  31.25 
 
 
553 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.524731  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2774  precorrin-3B synthase  33.83 
 
 
599 aa  259  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2499  ferredoxin-nitrite reductase  32.39 
 
 
586 aa  258  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1601  Ferredoxin--nitrite reductase  33.15 
 
 
591 aa  258  3e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0385812  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1298  ferredoxin-nitrite reductase  30.85 
 
 
553 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.948489  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0159  ferredoxin--nitrite reductase  28.66 
 
 
519 aa  257  4e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100051  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1240  ferredoxin-nitrite reductase  34.46 
 
 
512 aa  254  5.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.678631  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1754  ferredoxin-nitrite reductase  31.15 
 
 
586 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.188302  decreased coverage  0.00588237 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4231  ferredoxin-nitrite reductase  30.8 
 
 
590 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4137  ferredoxin-nitrite reductase  30.26 
 
 
604 aa  240  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298676  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0174  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  30.22 
 
 
603 aa  237  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50765  predicted protein  31.05 
 
 
633 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0523138  normal  0.66186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1785  ferredoxin-nitrite reductase  30.7 
 
 
590 aa  232  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2867  ferredoxin-nitrite reductase  30.43 
 
 
595 aa  232  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5008  ferredoxin-nitrite reductase  29.96 
 
 
596 aa  231  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.60308  normal  0.203418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3747  ferredoxin-nitrite reductase  30.15 
 
 
595 aa  231  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.718137  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4955  ferredoxin-nitrite reductase  29.77 
 
 
596 aa  229  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.463777  normal  0.237045 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4492  ferredoxin-nitrite reductase  29.96 
 
 
601 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.550136  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0048  hypothetical protein  31.24 
 
 
480 aa  226  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000197587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2299  ferredoxin-nitrite reductase  29.71 
 
 
605 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.598587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1737  ferredoxin-nitrite reductase  29.27 
 
 
608 aa  222  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3055  precorrin-3B synthase  28.81 
 
 
615 aa  214  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.71437  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1773  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  32.08 
 
 
553 aa  204  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.155846  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  31.12 
 
 
556 aa  204  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  30.91 
 
 
556 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1758  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  28.78 
 
 
555 aa  201  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0338  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  30.3 
 
 
556 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0988225  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1146  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  33.19 
 
 
697 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0655  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  29.46 
 
 
551 aa  197  5.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1931  ferredoxin--nitrite reductase  30.77 
 
 
556 aa  196  9e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3124  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  30.45 
 
 
564 aa  196  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>