More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1758 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0593  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  73.15 
 
 
556 aa  861    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.313736  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0181  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  58.83 
 
 
556 aa  683    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1153  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  74.23 
 
 
555 aa  881    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1825  Sulfite reductase (ferredoxin)  58.47 
 
 
556 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.291186  normal  0.363393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2148  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  57.63 
 
 
557 aa  668    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249832  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1101  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  58.29 
 
 
557 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.251663 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1942  sulfite/nitrite reductase hemoprotein subunit  72.97 
 
 
556 aa  861    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.78076  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0190  sulfite reductase (ferredoxin)  58.29 
 
 
556 aa  672    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0338  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  71.53 
 
 
556 aa  852    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0988225  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2558  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  58.5 
 
 
544 aa  659    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1773  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  71.53 
 
 
553 aa  825    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.155846  normal  0.725571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2261  sulfite reductase (ferredoxin)  58.88 
 
 
553 aa  674    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.533982  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1758  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  100 
 
 
555 aa  1146    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0770  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like protein  58.14 
 
 
543 aa  651    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259227  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0175  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  58.83 
 
 
556 aa  680    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.815169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3991  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  58.35 
 
 
556 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.661802  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0889  sulfite reductase (ferredoxin)  58.05 
 
 
552 aa  679    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0812727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0655  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  66.79 
 
 
551 aa  765    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3267  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  56.1 
 
 
552 aa  639    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1638  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  58.83 
 
 
556 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.123155  normal  0.260957 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4013  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  55.56 
 
 
550 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4694  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  55.27 
 
 
551 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1401  sulfite reductase, hemoprotein subunit  54.3 
 
 
550 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0403368  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6980  sulfite/ferredoxin-nitrite reductase  54.73 
 
 
551 aa  626  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4058  sulfite reductase (ferredoxin)  55.03 
 
 
544 aa  625  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.639199  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1931  ferredoxin--nitrite reductase  54.97 
 
 
556 aa  621  1e-177  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1381  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  54.55 
 
 
551 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.244986  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1397  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  54.28 
 
 
551 aa  622  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3274  sulfite reductase (ferredoxin)  55.29 
 
 
669 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3124  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta-component ferrodoxin domain protein  54.95 
 
 
564 aa  608  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2059  nitrite/sulfite reductase protein  51.74 
 
 
548 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155547  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2371  sulphite reductase hemoprotein, beta subunit  50.18 
 
 
550 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3324  sulfite reductase (ferredoxin)  50.18 
 
 
550 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2912  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  51.37 
 
 
557 aa  592  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.198106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1884  sulfite reductase (ferredoxin)  50 
 
 
550 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2513  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  51.54 
 
 
557 aa  595  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67153  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  54.48 
 
 
545 aa  594  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.135047 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0962  sulfite or nitrite reductase  52.34 
 
 
557 aa  591  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.350466  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1978  sulfite reductase (ferredoxin)  50 
 
 
550 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.126005  normal  0.0650245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1671  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  49.55 
 
 
558 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0706341  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10550  putative sulfite or nitrite reductas  52.34 
 
 
557 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2730  sulphite reductase  49.09 
 
 
552 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.759699  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2462  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  49.09 
 
 
552 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133864  hitchhiker  0.0089814 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2696  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  51.81 
 
 
560 aa  579  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0798  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  51 
 
 
560 aa  581  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2345  sulfite reductase (ferredoxin)  49.73 
 
 
553 aa  575  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0166972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2425  sulfite reductase oxidoreductase protein  51.81 
 
 
553 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3112  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  48.55 
 
 
552 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0819  ferredoxin--nitrite reductase  50.18 
 
 
559 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3940  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like:nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  51.09 
 
 
568 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2392  sulfite reductase (ferredoxin)  49.46 
 
 
559 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2147  sulfite reductase (ferredoxin)  49.64 
 
 
552 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0201969  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2816  sulfite reductase (NADPH) subunit beta  50.54 
 
 
560 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377883  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40770  sulfite reductase  48.65 
 
 
552 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74513  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1528  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  49.45 
 
 
550 aa  571  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.245681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3457  sulfite reductase  48.29 
 
 
552 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.998056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1166  sulfite reductase  49.1 
 
 
589 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.878601  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2480  sulfite reductase (ferredoxin)  49.46 
 
 
559 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1864  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  49.46 
 
 
559 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2689  Sulfite reductase (ferredoxin)  50.72 
 
 
553 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.671477  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1013  sulfite reductase, ferredoxin subunit  49.1 
 
 
559 aa  568  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2524  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  49.64 
 
 
559 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2475  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  49.46 
 
 
559 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187728  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5806  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  49.1 
 
 
559 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2229  Sulfite reductase (ferredoxin)  50.72 
 
 
553 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3664  sulfite reductase (NADPH) beta subunit  49.1 
 
 
559 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1891  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  48.36 
 
 
550 aa  568  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1662  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  48.92 
 
 
559 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2348  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  48.92 
 
 
559 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2235  sulfite reductase (ferredoxin)  49.19 
 
 
559 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0663  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  48.92 
 
 
559 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.6828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0814  sulfite reductase  48.92 
 
 
589 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0970  Ferredoxin--nitrite reductase  48.92 
 
 
559 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1006  sulfite reductase, ferredoxin subunit  48.92 
 
 
559 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2937  sulfite reductase (NADPH) hemoprotein beta-component  48.92 
 
 
559 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.655156  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0345  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  49.09 
 
 
570 aa  560  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1862  sulfite reductase oxidoreductase protein  52.22 
 
 
577 aa  552  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.816955  normal  0.207611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1503  putative nitrite/sulfite reductase  49.91 
 
 
569 aa  551  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0107318  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2784  sulfite reductase (ferredoxin)  51.27 
 
 
568 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163848 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27520  Sulfite reductase, beta subunit (hemoprotein)  50.54 
 
 
552 aa  552  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2013  sulphite reductase  50 
 
 
554 aa  547  1e-154  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160364  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3156  sulfite reductase (ferredoxin)  47.55 
 
 
552 aa  543  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240199  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2339  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component, ferrodoxin-like  46.62 
 
 
608 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5829  sulfite reductase (ferredoxin)  47.19 
 
 
596 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.635326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2427  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  47.01 
 
 
602 aa  541  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1354  nitrite/sulfite reductase, hemoprotein beta-component  46.92 
 
 
594 aa  536  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249924 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4652  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  46.72 
 
 
629 aa  535  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  hitchhiker  0.00315368 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4393  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  47.77 
 
 
594 aa  535  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196691  normal  0.0835923 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5807  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  47.43 
 
 
594 aa  532  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3929  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  47.43 
 
 
594 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4515  Sulfite reductase (ferredoxin)  46.5 
 
 
596 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0922  putative nitrite/sulfite reductase  47.26 
 
 
595 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.465808 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1264  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  46.74 
 
 
551 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.657041  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4335  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  46.22 
 
 
593 aa  522  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.321125  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1568  nitrite/sulfite reductase family protein  47.14 
 
 
729 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1435  sulfite reductase, beta subunit  46.97 
 
 
633 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1466  sulfite reductase, beta subunit  47.14 
 
 
633 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2456  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S protein  45.89 
 
 
605 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0525  nitrite/sulfite reductase family protein  46.97 
 
 
633 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3053  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  45.18 
 
 
616 aa  521  1e-146  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304429  normal  0.13833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>